仁济医院药剂科是一个集药事管理、药学服务、科研教学为一体的综合型医技科室。是复旦大学、上海交通大学、上海医药职工大学、上海市药剂学校等院校的毕业实习基地，卫生部心血管内科专业、抗感染专业临床药师培训基地。药剂科立足于药品的供应和质量保证，积极探索高品质的医院药事管理，不断提升临床药学服务内涵和能力，促进合理用药。坚定不移地把科研兴科、人才强科摆在突出的战略地位，坚持观念创新、内涵发展的道路，把“安全、有效、经济、合理”作为药学工作的核心目标。
科室设有门急诊药房、住院药房、干保药房、药库、静脉药物配制中心、临床药学实验室、I期临床研究室、临床药学室等部门；现有职工169人，其中主任药师4人，副主任药师6人；博士生导师1人，硕士生导师2人；具有博士学位者3人，硕士学位者10人，大专以上学历人员占有率为90%以上，形成了老中青结合、高中初级职称合理搭配的人才梯队。
药剂科学术氛围浓厚，治学严谨，研究方向明确，结合临床工作，致力于医院药学的发展。开展药代动力学、药效学、药物流行病学、药物经济学、药事管理学、药品质量评价、药品信息化等方面的研究。近年来，在国内外学术刊物上发表科研论文100余篇，SCI收录论文 20多篇，申请获得10项专利，参编多部学术专著。承担了国家杰出青年科学基金、国家新药创制科技重大专项、国家自然科学基金面上项目、国家“863”课题、上海市科委科技支撑项目、上海市科委医学领域重点项目、上海市卫生局中医药科研基金等项目。其中，药物经济学指导下的合理用药研究以及基于海洋及天然药物研发的新药研究水平已经处于国内领先水平。
主要部门介绍：
药品调剂是药剂科日常工作的重要部分，门急诊窗口直接面向广大患者，住院药房服务于医院各个病区，承担着繁忙而琐碎的工作。药师们怀着高度的责任心，以扎实的药学专业基础，细致严谨的工作态度，“四查十对”的标准流程，年中无休地服务在医疗第一线。工作重心从单纯的“供应型”向“服务型”转变，实施多项便民措施，提出亲友式的服务理念，开展处方点评及合理用药咨询，在“全国青年文明号”的荣誉下，全体药师不断提高自我、努力前行。
静脉药物配制中心将原来分散在病区治疗室开放环境下进行配置的静脉用药，集中由专职的技术人员在洁净、密闭环境下进行配置。通过药师审方、调剂、复核、冲配复核和包装复核等多个环节的严格控制，最大限度地减少因各种因素导致的用药错误，确保了药品质量和输液安全，构建了与临床医生探讨合理用药的途径，及时发现并纠正问题处方或用药不当。同时减少了化疗药物对病区环境的污染，并进一步加强了医护人员的职业防护。静脉药物配制中心有着先进的洁净设备、合理的流程设计、完善的操作规程，确保为临床提供优质的药学服务。目前已覆盖医院心内科、消化内科、血液科、肿瘤科、骨科、神经外科、移植中心等近40个病区，日均冲配量2700余帖，TPN50余袋，
I期临床研究室主要进行新药的人体耐受性试验和药代动力学研究，配备了齐全的抢救和检测设备，有Bennett 7200呼吸机、ZOLL PD TM1200除颤器、NIHON KOHDEN ECG-1250C心电图机以及相关急救药品，AB SCIEX 3200 QTrap液质联用仪（LC-MS-MS）、WATERS 1525/2487高效液相色谱仪（HPLC）、HP6890N气相色谱仪（FID/ECD）、岛津 UV-2101PC紫外可见分光光度计、BECKMAN TM-30 高速离心机、三洋MDF-U53V型超低温冰箱等。实验室拥有严格的管理制度、细致的标准操作规程（SOP），几年来完成了十多项I期临床试验，其中包括多项国家1.1类新药的I期临床。2011年经中国合格评定认可委员会（CNAS）评定，成为上海第二家、全国第六家通过ISO17025认可的药代动力学检测实验室。在硬件基础、检测水平及实验室管理上都有了大幅度提升，为今后I期临床研究的开展奠定了良好基础。
临床药学组拥有一支高素质的专业临床药师队伍，开展处方及医嘱点评，对不合理用药情况进行汇总分析，提高合理用药水平；深入临床，参与交班、查房、抢救和病例讨论，建立患者药历，对药物治疗提出建议；对用药情况进行调查，结合药物经济学的原理和方法，对药物利用情况、用药趋势、抗菌药物临床应用等进行评价，提出指导性意见；收集临床药品不良反应报告，做好药品不良反应监测的分析、归类、综合和存档工作，定期上报市药品不良反应监测中心；承担药物情报资料和信息咨询工作，收集整理药物治疗的信息资料，为临床医生和病人提供迅速、准确的信息；对出院病人进行用药教育，宣传合理用药知识。定期编撰《仁济药讯》、《仁济药物手册》及《仁济处方集》，为医务人员提供药物信息支持。