泌尿外科是上海儿童医学中心于2013年新近成立的临床科室，原属于普通外科领域的一个分支。科室的成立，标志着上海交通大学医学院附属的专科医院中开始建立独立的儿童泌尿生殖专业，这将极大地有助于专科疾病诊疗技术的提升。虽然，作为一个临床科室，泌尿外科还处于起步阶段。但是，其学科建设却贯穿了医院成立至今的整个发展过程。
　　学科的创建受到全国儿童泌尿外科奠基人李衷初教授的鼎力支持，多位专业界的顶尖人物都曾工作于此。历经多年磨练，在整个团队的共同努力下，逐渐形成了集临床与科研的双轨制发展，是上海交通大学先天性泌尿生殖系畸形外科诊治中心。科室拥有的诊疗设备涵盖膀胱镜、腹腔镜、超声刀及尿动力仪等多种。常规的诊疗项目，包括三点固定术式治疗隐匿性阴茎、尿道板纵切治疗尿道下裂、膀胱扩大治疗小膀胱症、尿流改道治疗难治性尿失禁、以及腹腔镜诊治等技术，在全国处于领先水平。同时，针对儿童性腺缺失畸形，在国内率先开展了睾丸假体移植，填补了相关领域的空白。科室领衔主持的国家级研究课题有3项，市级课题有2项，是上海市卫生局“儿童泌尿外科腹腔镜诊治及重建技术应用研究”项目的重要支撑单位。
　　目前，科室配备主任医师2位，高年资主治医师1位，硕士研究生导师1位。专业医师中有3人获得博士学位，数名在读研究生。拥有普通床位20余张，特需病床10张。平均每年收治住院病人近2000例，并呈逐年上升趋势。相信在国家新一轮的发展规划中，随着医院规模和科室队伍的不断壮大，我院泌尿外科将进一步巩固其在全国的领先地位，成就一个集临床诊断、治疗及科研为一体的专业学科团体。