东方医院病理科自成立以来，在医院各级领导的关怀指导下，经过几代人的努力，不断向前发展，目前拥有病理学硕士授予点并承担着医疗、教学、科研三方面的重要任务。逐渐形成了一支专业知识较全面结构合理的队伍，有教授、主任医师1名，主治医师3人，主管技师1人，其他各级医、技人员5名。科主任王军臣教授担任上海市卫生局临床病理质控中心专家委员会委员，同济大学临床医疗质量控制专家委员会委员兼临床病理专家组组长,浦东新区医学会病理专科学组组长。同时承担硕士研究生、同济大学医学院的病理学课程。在《中华病理学杂志》、《诊断病理学杂志》、《中国癌症杂志》等专业期刊发表论著20余篇，参译大型专著一部。

科内有取材室，切片室，染色室，细胞学，免疫组化实验室，此外还有资料室和图像分析室。病理科仪器设备精良，能够开展临床病理和实验病理的诊断及基础研究。病理科年活检量1.4万余例,术中冰冻1200余例,细胞学3000例;应用组织学、组织化学、免疫组织化学及分子生物学的手段和技术辅助诊断。

科研方面，多年来承担上海市、浦东新区课题数项，主要科研方向：临床病理及其靶向药物病理学;组织芯片研发及其癌发生与转移分子病理学研究;基因敲除和小分子RNA干扰技术;宫颈上皮内瘤变的发病机制以及转归;肺癌干细胞的筛选与鉴定等。