中山医院病理科成立于1992年，在前任科主任陈长春教授、潘文生教授、谭云山教授的带领下，经过20余年的发展，成为拥有15名医生、16名技术人员，布局合理、流程规范，共计约1500平方米的科室。病理科分为组织病理、免疫病理、分子病理、细胞病理四大部分，同时参与中山医院组织库建设，与中山医院部分分院建成网络病理平台，正在加入全国远程病理会诊系统的建设，以及与国外数个医院远程交流的平台。病理科现任科主任侯英勇主任医师、副主任纪元主任医师和陈岗教授。科室医生中，高级职称7人、主治医师5人，住院医师3人（其中2人正在接受临床病理专科基地培训），具有博士学位46.7%，硕士学位30.7%。博士生导师2人，硕士生导师3人。目前正在病理科接受病理基地培训的医师18人。技术组中，主管技师4人，技师11人，其中硕士1人。其他工作人员5人。
　　中山医院病理科年外检量于2014年已超100,000例，每年完成术中冰冻8600例，急诊病理9000例，会诊病例5000例，免疫组织化学检测项目接近300项，2014年完成17000例。标本来源广泛，涵盖手术切除、内镜活检、细针穿刺等，包括肝脏肿瘤约3000例/年，肺肿瘤约1000例/年，食管肿瘤约600/例，胃肿瘤约1200例/年，肠肿瘤约1200例/年，乳腺肿瘤约500例/年，妇科活检及手术标本约2000例，前列腺癌约300例/年，肾癌约600例/年，纤支镜约1500例/年，消化内镜下活检以及内镜下切除标本约55,000例/年，其它骨与软组织肿瘤约2000例/年，骨髓活检约2000例/年。细胞病理学项目包括穿刺20,000例/年，脱落细胞学5500例/年，液基细胞学12,000例/年，妇科体检10,000例/年。诊断医生熟悉各种良恶性肿瘤以及非肿瘤性疾病的诊断与鉴别诊断。
　　在分子病理检测上，开展了原位杂交、荧光原位杂交，建立了符合“临床基因扩增检验实验室基本设置标准”的临床PCR实验室，并严格执行临床基因扩增实验室工作和管理规范，以保证临床基因扩增检验质量，使临床诊断和治疗更为科学。已配置了临床分子病理诊断中各项技术开展所需的多种仪器设备。开展了多项应用于病理诊断和靶向治疗相关的分子病理检测项目，如KIT、PDGFRA、K-ras、N-ras、B-raf、PIK3CA、EGFR等基因突变检测，IgH、TCR基因重排检测、开展了EBER、HER2、SS18、bcl-2、bcl6、c-myc、MALT、EWS、MDM2、CDK4、DDIT3、CCND1、MET、EGFR、Urovysion、PIK3CA、FOXO1、FUS、P53、D13S319、D13S25、RB1、1q21、ATM、CSP12、ALK、ROS1等基因的CISH和FISH检测。参与国内外室间质控项目，均获得通过。目前正在进行二代测序的预实验及筹备工作。
　　承担不同来源学员的教学工作，包括病理进修医师、各基地轮转医师、各科室实习医师以及该科室研究生。进修医师3～6人/年、研究生1～3人/年、基地医生5～8人/年、轮转医生近百名。历年来连续举办国家级继续教育学习班，系统介绍细针穿刺、术中冰冻【2014-01-04-075（国）】以及病理科在疾病多学科团队诊疗中的作用【2015-01-04-021 (国)】等。2010年获得上海市病理专科基地，已完成数届病理医生的培养。2014年获得上海市普通病理专科、肺部疾病病理专科、消化系统病理专科以及淋巴系统病理专科基地，同年，开设了胸部病理亚专科。
　　共获得11项国家自然科学基金、以及多项上海市科委、上海市卫生局课题，在Nat Med、Am J Respir Crit Care Med、Modern Pathology、Histopatholgy等著名刊物上发表文章，在中华病理杂志、中华移植杂志发表系列文章。历年在中华医学会病理学年会大会发言。创建多种技术和方法，申请专利十余项。参与多种疾病指南的制定，如WHO肺癌和胸腺肿瘤病理学分类，尘肺病理诊断国家标准，参与制定“中国胃肠道间质瘤诊断治疗共识”，“中国非小细胞肺癌患者表皮生长因子受体基因突变检测专家共识”，“原发性肝癌规范化病理诊断方案专家共识”，主编《胃肠道间质瘤》、《肝胆胰肿瘤――病理、影像与临床》，参编《纵隔淋巴瘤》、《胸膜间皮瘤病理学》、《肺肿瘤》等，参译《软组织肉瘤诊疗学》等多本专著。鉴定多项科技成果，获得包括上海市科技进步奖三等奖在内的多项奖励。