上海同仁医院呼吸内科是一个诊疗技术全面、服务意识强、团结进取，集医疗、教学、科研于一体的科室，其“呼吸机治疗和呼吸支持单元”是医院的特色专科。呼吸科现有开放床位29张，其中监护病床4张。呼吸科医护力量雄厚，医生均具有本科以上学历，有丰富的临床经验，现有中级职称以上人员6人，其中主任医师1人，副主任医师2人。
　　学科带头人金晓燕曾荣获长宁区第三轮优秀青年人才称号，是长宁区第四轮优秀专业技术人员希望奖获得者 ，现任长宁区医学会肺科学组组长。呼吸科还聘请中山医院呼吸病专家、博士生导师，复旦大学呼吸病研究所副所长，中华医学会上海肺科学会副主任委员蔡映云教授担任顾问，不定期来我科会诊、讲学及科研指导。与瑞金医院呼吸科也有多项科研、技术合作。
　　呼吸科拥有独立的气管镜室，有日本Olympus纤维支气管镜2台。有独立的睡眠室，配有先进的多导睡眠监测仪供病人进行整夜睡眠监测。拥有高档进口呼吸机5台、多台进口监护仪。对于呼吸系统疾病的诊断、重症患者的抢救治疗达到国内先进水平，在肺炎、慢性支气管炎、支气管哮喘、肺心病、呼吸衰竭等常见多发病的诊治方面有独到的经验，特别在无创和有创机械通气方面具有丰富的临床经验，重症呼吸衰竭抢救成功率高。呼吸科在保证常规医疗工作的同时积极开展新技术、新项目如无痛纤维支气管镜术和睡眠呼吸障碍的诊治，积极开展科研，在中华及核心期刊上发表论文10余篇，同时还承担多个医学院的教学任务。