上海第六人民医院中医科成立于上世纪50年代初年，1992年建立病房，现对外开放床位22张，设有中医内科、中医肛肠科两个亚学科。科室现有上海市名老中医1人，正高职称7人，副高职称3人，博士5人，硕士3人，博导1名，硕导3人。

　　长期以来科室坚持运用中医药、中西医结合等技术手段治疗缺血性脑血管病逐步摸索积累和制定了一套医术丰富的诊疗经验与较为成熟的防治结合方案，2005年中医内科被列为国家药品监督管理局中医脑病新药临床试验资格认定单位，同年科室被评为医院中医药治疗缺血性脑血管病特色专业。目前是上海市中西医结合学会活血化瘀专业委员会主任委员单位、中国中西医结合学会活血化瘀专业委员会副主任委员单位、国家中医药管理局综合性医院中医科重点专科建设单位，上海市综合性医院示范中医科及上海市中医脑病优势专科。

　　长期以来科室坚持以中医学理论为指导，广泛吸取各家之长，融中西医于一体，秉承中医药为主，中西医结合的理念，充分发挥中医药特色优势，擅长以化痰通络，清热化瘀治疗短暂性脑缺血发作、脑小血管病、脑梗死、椎基底动脉供血不足等缺血性脑血管病；对呼吸、消化、心血管及泌尿系统等常见病、多发病、疑难杂症以及肿瘤的中医药康复治疗也具有丰富的诊疗经验，如清热化瘀舒肝养阴治疗慢性肝病肝纤维化、健脾消痞治疗慢性胃炎胃癌前病变、补肾化瘀治疗子宫内膜异位症、舒肝活血化痰治疗脂肪肝、升阳散火治疗三叉神经痛、活血化瘀滋阴补肾治疗糖尿病及其并发症、扶正祛邪抗癌治疗等等。在临床诊疗的基础上，积极开展相关科学研究。目前承接上海市科委、上海交通大学、上海市卫生局、上海申康医院发展中心等十余项科研项目。

　　中医科一直承担上海交通大学医学院五年制本科、八年制硕博连读临床医学专业的中医学理论教学、上海中医药大学见习和实习以及研究生教学任务。