儿科创建于上世纪50年代初期。在我国著名儿科专家宋杰教授，王子才教授和现任知名儿科专家张建华教授等三代儿科人的努力，目前已形成以小儿呼吸、小儿神经、小儿心理行为、新生儿、小儿肾脏病、营养及免疫性疾病为特色，包括小儿急救、血液、心血管、消化等专科，集临床、科研与教学为一体的临床学科。为上海交通大学儿科学硕士、博士培养点，上海市住院医师（儿科）规范化培训基地。开设床位62张（东院暂定：普儿10张，新生儿5张），年平均住院病人2700人左右，年平均门诊就诊人数14.5万人次。拥有一支90%以上由医学硕士、博士、博士后组成的医疗、教学、科研技术骨干队伍，其中主任医师/教授6名，副主任医师/副教授7名。为中国康复医学会儿童医学康复委员会副主委、全国儿童哮喘协作组委员单位。

　　儿科配置有先进的新生儿/婴儿呼吸机（进口）、新生儿红外线抢救台、听力筛查仪、肺功能测定仪、智力检测系统、过敏源检测体系等设备。近年来，承担国家自然科学基金2项，上海市及省部级课题5项，市局级课题8项；获省部级、市局级等科技进步奖9项，其中一等奖2项；发表期刊源以上学术论文200余篇，其中SCI 10篇，参与编写专著与教科书等10部；培养硕士研究生20余人，博士研究生3名。

　　诊疗技术与特色
　　一、神经与心理行为疾病
　　在国内较早开展脑瘫早期、小儿心理行为疾病的诊疗及家庭康复训练。对小儿癫痫、小儿多动症、多发性搐动症、孤独症的诊疗、高热惊厥防治，以及中枢神经系统感染性疾病、具有丰富的临床经验与理解。拥有脑电图、脑放射性核素扫描（SPECT、ECT）、脑CT、MR诊断技术，智力心理测试系统。

　　二、呼吸与感染性疾病
　　急性和反复呼吸道感染、传染性单核细胞增多症、尤其是儿童哮喘和小婴儿喘息性疾病、儿童慢性咳嗽的诊断及治疗。拥有呼吸辅助通气，肺部CT诊断，肺功能、过敏源检测技术。

　　三、新生儿疾病
　　高危新生儿、早产儿、极低出生体重儿、新生儿呼吸窘迫综合征、溶血病、黄疸、颅内出血、缺氧缺血性脑病、感染与败血症的诊断及治疗。拥有呼吸辅助通气、换血、听力筛查等技术。

　　四、肾脏疾病
　　血尿、蛋白尿、IgA肾病、肾病综合症、乙肝相关肾炎、紫癜性肾炎、狼疮性肾炎、急性肾功能衰竭等诊疗。拥有肾活检、病理诊断技术。

　　五、免疫性疾病
　　对小儿类风湿性疾病、系统性红斑狼疮、过敏性紫癜等疾病的诊疗具有较为丰富的临床经验。拥有较为全面的临床免疫检验系统。

　　六、营养性疾病
　　小儿佝偻病、营养性贫血、厌食症、肥胖症等疾病的诊疗。拥有佝偻病早期诊断技术，厌食症和肥胖症干预方案。

　　七、消化系统疾病
　　腹泻病、急慢性胃十二指肠炎、胃溃疡、肠道微生态失调等疾病的诊疗。拥有粪便RV抗原检测、13C Hp呼气试验检测、胃肠GI和胃肠镜检查技术。

　　八、心血管疾病
　　心律失常、病毒性心肌炎、川崎病的诊断及治疗，拥有心电图、电生理、超声诊断和同位素检测技术。

　　九、血液系统疾病与肿瘤
　　血小板减少性紫癜、白血病、淋巴瘤、嗜酸性肉芽肿、神经母细胞瘤等疾病的诊疗。拥有骨穿、骨髓活检、骨髓象分析、骨髓病理检测技术。