上海市第六人民医院东院内分泌代谢科拥有15张普通床位，医师团队由具有硕博士学位的5位医师组成，梯队合理，服务优质，并坚持三级医疗查房制。在门诊建立了糖尿病慢性病综合管理的电子档案，开展糖尿病并发症筛查、治疗一站式服务及定期的糖尿病教育，建立了规范化、优质化的诊疗流程，对糖尿病患者进行分型诊断、个体化教育、营养咨询、运动计划、高危人群防治、糖尿病足病、糖尿病眼病、糖尿病肾病、糖尿病神经血管病变筛查治疗、动态血糖监测及胰岛素泵的诊疗等，并建立了“糖尿病多学科联合诊治”平台和中心化诊治模式，尤其是在治疗糖尿病足的方面有独特的疗效。同时内分泌科与周围社区卫生服务中心建立了糖尿病慢性并发症的防止网络，实施了医院-社区糖尿病一体化管理新模式。在肥胖、甲状腺疾病的诊治方面也有独到之处。在肾上腺疾病、下丘脑垂体疾病等内分泌代谢疾病的诊断和治疗方面有较强的实力。内分泌科还承担培养研究生和进修生及本科实习生的任务，开设浦东新区继续教育项目。
　　　　
内分泌学科以包玉倩为学科负责人。首次提出了中国人腹型肥胖的精确诊断及临床适用标准，牵头制定中国人代谢综合征诊断标准，被纳入《中国成人血脂异常防治指南》。首次揭示了10个关键基因的“体脂调控网络”在肥胖发病机制中的作用，发现了巨噬细胞通过产生血小板衍化生长因子（PDGF）参与脂肪组织血管新生形成，提出了载脂蛋白apoC III调控肝脏极低密度脂蛋白（VLDL）的新机制。成果在《JBC》、《Atherosclerosis》、《Int J Obes》、《AJP》等国际权威杂志发表，论著12篇，获2001年上海市科技进步一等奖。另外也获得国家973和国家科技支撑计划、国家自然科学基金项目。此外，本科与国际知名的加拿大多伦多大学糖尿病研究中心开展了深层次合作。