血液科是医院内科系统的主要科室之一。科室随铁道部北京铁路总医院的建立而建，近年来随着医院的发展，经过老中青三代人员的努力，血液科已逐步发展成为集医疗、教学、科研于一体的科室。目前，科室有普通质控病床24张，100级层流洁净病房2间，简易层流洁净病房(单人间)2间，专科实验室1个。血液病专业临床医师9名，主任医师2名，副主任医师2名，主治医师1名，住院医师4名，科内多数医师有出国访学或行医经历，与国内外同行建立了广泛的联系。
　　2004年以来，医院为血液科的基本建设进行重点支持，共投资450余万元对血液科进行整体改造，建成了100级无菌层流病房，并购置了相关设施，充实并更新了科室有关血液病实验室的基本设备配置，包括：系统显微镜，BD FACSCalibur四色六参数流式细胞仪，COBE Spectra血细胞分离机，骨髓细胞形态学图像系统，染色体图像分析系统，CO2培养箱以及其它实验室相关设备。同时，医院也对血液病实验室进行了基础建设投资，建成了100多平米的独立实验室，可进行组织学、细胞学、免疫学、遗传学和分子生物学等实验工作。
　　血液科技术力量雄厚，医疗设备精良，住院环境温馨，医疗服务优质。目前，科室主要围绕各类血液系统疾病的临床诊疗开展工作，在各类贫血、出血、凝血系统疾病、各种白血病、淋巴瘤、多发性骨髓瘤以及其它血液系统疾病的诊断、治疗和康复工作等诸多方面，均积累了丰富的临床经验，并掌握了先进有效的诊疗技术。
　　科室担负着对基层医院有关血液系统疾病的专科指导、会诊及远程会诊工作，住院医师和全科医师规范化培训工作，首都医科大学血液病学系本科及研究生教学，北京大学医学部预防医学系血液病专业理论和实习教学等工作。