深圳市第二人民医院呼吸科是深圳市最早成立独立呼吸科病房的科室，共开设病床80张，具有呼吸机、纤维支气管镜、肺功能等先进设备，下设呼吸科普通病房、重症病室，肺功能室、电子支气管镜室、睡眠呼吸障碍诊疗室和呼吸科门诊（包括特需门诊、专家门诊和普通门诊）。该科拥有一支经验丰富技术精湛的医疗队伍，医护人员共有34名，其中正高级职称4名，副高6名，具有博士学位有4人，硕士学位14人。
　　开展业务：呼吸衰竭的诊治、肺部感染性疾病诊治、慢性阻塞性肺部的治疗和管理、哮喘的诊治及研究、肺癌的介入治疗等。年门诊量达6000人次，年住院病人达1800人次。
　　专科优势：专科优势临床技术有慢阻肺及哮喘的规范化诊疗、肺癌的早期诊断及介入治疗、呼吸危重症救疗等。专科特色是慢性呼吸疾病规范化门诊、采用各项活检技术结合血液肿瘤细胞的基因检测早期诊断肺癌、无创机械通气治疗急慢性呼吸衰竭、下辖“深圳大学呼吸疾病研究所”广泛开展哮喘及肺癌的相关临床研究。
　　该科拥有Drager-Evita4、拉菲尔呼吸机各1台，无创呼吸机6台,多功能监护仪10台，电子气管镜及图文处理系统2套，纤维支气管镜3套，电子可弯曲内科胸腔镜1台，大型肺功能仪2台等先进仪器设备。目前该科能够开展急、慢性呼吸衰竭病人的机械通气支持，经气管镜行肺活检、灌洗、刷检、针吸及气管旁淋巴结活检，肺功能检查、药物气道激发和舒张试验，运动心肺功能检查，睡眠呼吸障碍监测和治疗，经皮胸膜活检术，经皮肺穿刺活检术和内科胸腔镜检查。该科在治疗急、慢性支气管炎、肺部感染、气胸、支气管哮喘、肺气肿、肺心病、肺脓肿、支气管扩张、肺栓塞、肺癌、肺纤维化、各种原因引起的咯血、胸膜炎、呼吸道过敏症等疾病方面均有系统的研究，尤其在慢性咳嗽、肺部块影、结节以及肺部真菌感染疾病的诊疗方面积累了较为丰富的经验。