消化科是黑龙江省医院消化分院协作科室。医疗设备先进,拥有日本富士能电子胃镜、欧林巴斯十二指肠镜和结肠镜。医疗技术力量雄厚,胃、肠镜检查,诊断率高,诊治常见病、疑难病科学规范,此外,内镜下诊断和治疗技术在我市处于领先地位。开展的诊疗技术有:胃、肠镜下息肉电切除术;胃、肠异物、胃石取出术;V2胃胶喷洒治疗上消化道出血;还采用介入技术进行食道支架置入术,治疗食道良性狭窄,食道癌;逆行胰胆管造影(ERCP),诊断胰、胆系统疾病;在我市首家开展了十二指肠乳头切开网蓝取石术治疗胆总管结石;并开展了目前国内先进的内镜下介入治疗慢性胰腺炎(包括取胰石、胰管狭窄扩张、置胰管支架)技术。