皮肤肛肠科成立于2002年，已诊治肛肠病上万例，并取得良好的疗效。科室拥有男女医师3人，其中主治医师2人、医师1人。学科建立了完善的中西医结合治疗模式，有传统中医药的内服、外用、熏洗、枯痔等疗法，也有中西医结合的切挂、结扎等疗法，并结合皮肤科知识治疗肛肠术后并发症如切口不愈合、湿疹等，还有现代的激光、目前最先进的肛肠治疗仪（具有“电子眼”之称的电子肛门直肠镜，五分钟即可拍摄色彩清晰、层次分明的肛门直肠粘膜彩色影像图，肛肠病变一目了然。该仪器是应用 HCPT 技术的第四代智能型肛肠治疗仪，采用了数字智能识别功能，先采集治疗组织的基本数据，发送到计算机处理中心，然后根据计算机处理中心的指令使组织达到治疗目的）等现代疗法，尤其在治疗严重肛门直肠周围脓肿、高位复杂性肛门直肠瘘和复发性肛门直肠瘘、环状痔、嵌顿性痔、严重肛门直肠狭窄、排便障碍(便秘)、急重肛肠病术后并发症等肛肠科疑难急重症方面疗效优异。学科带头人是福建省中西医结合肛肠分会委员，莆田市皮肤与性病医学分会委员，并引用福建省人民医院肛肠科研制的紫白膏、消炎生肌膏等专科制剂，疗效显著。经过系统性进修的医师队伍、一流的专科检查设备、熟练的微创无痛手术技巧、中西医结合特色专科疗法，秀屿区医院皮肤肛肠科为许多的有“痔”之士解除了后顾之忧。