病理科现有职工6人，其中诊断组3人（主任医师1人，副主任医师1人，主治医师1人），技术组3人（主管技师1人，技师2人）。下设分子生物学实验室、免疫组织化学室、酶组织化学和组织化学室、图像分析室等。具有较强的动物实验和人体病理研究的科研能力。同时承担南京医科大学本科生、研究生的病理学教学工作、带教来院进修生，实习生、并指导二级医院的临床病理诊断。
　　该科开展对全身各部位组织活检的病理诊断，冰冻或快速切片诊断，各种疑难疾病及特定专科疾病的诊断与病理分型，尸检和猝死的病理诊断，各种体液细胞学（如胸、腹水、痰、尿液、脑脊液等）和宫颈刮片细胞学的诊断，肿块细针穿刺（包括在CT引导下的细针穿刺）的组织和细胞学诊断，内窥镜刷片细胞学的诊断以及阴道细胞学激素水平的测定等。并能开展20种以上特殊染色和代表现代医学水平的免疫组织化学（免疫病理）、细胞凋亡、原位杂交、病理图像分析、病理图文报告等新技术。近年来在省内率先开展了酶组织化学、神经活检、肌肉活检技术和活检标本的病理诊断。2004年撰写论文4篇，在全国核心期刊发表论文2篇。参编书《江苏省病理医师三级训练》、《江苏省医疗机构与诊疗规范病理学分册》2部。获本年度院新技术新项目二等奖1项。