普胸手术方面每年开展食管贲门癌切除术数百例，由于手术方式的改进及术后早期肠内营养的支持，近年来术后吻合口瘘发生率几乎为零。近年对高龄、晚期食管癌进行了探索，积累了丰富经验，结合围手术期的辅助放化疗，大大提高了手术切除率及远期存活率。常规开展肺叶切除手术，近年来开展了气管及隆突部肿瘤的切除手术，支气管袖状切除术，肺动脉、支气管双袖状切除成形术。扩大手术切除肺癌的治疗，包括肺癌侵犯心脏的手术治疗，肺癌合并上腔静脉综合症的手术治疗等。开展了巨大纵隔肿瘤切除术。在国内较早开展重症肌无力手术治疗的基础上，进一步完善了重症肌无力综合治疗，对重症肌无力的围术期处理积累了一套完整的治疗经验，提高了手术治疗效果，手术治疗有效率达90%。长年来，对普胸手术的方法有了大胆的创新，对纵隔、肺、食管肿瘤侵犯上腔静脉、无名静脉、主动脉等大血管，采用同期肿瘤切除及血管旁路或人造血管移植等方法手术治疗，使得一些常规方法下无法切除的肿瘤得以切除，扩大了肿瘤外科治疗范围，延长了患者的生存时间。
　　心脏手术方面先天性心脏病的手术治疗是科室的传统优势项目，常规开展各类先心手术。目前我科还开展各种微创先心病手术，如小切口先心病直视手术、介入或胸壁打孔行房间隔缺损和室间隔缺损封堵术。我科是南京市较早成功施行心脏瓣膜手术的单位之一，现每年心脏瓣膜置换手术数十例次，其中重症心脏瓣膜、多瓣膜置换及急症心脏瓣膜置换手术占有1/3。目前瓣膜手术成功率高达到98％左右，手术治疗效果好。多年来，我科先后开展了多项新技术、新手术，如二尖瓣综合成形术、保留瓣下结构或全瓣保留的二尖瓣置换术、二尖瓣和主动脉瓣置换术同期主动脉根部拓宽术、主动脉瓣成形术、三尖瓣成形术、心脏瓣膜置换术同期行冠脉搭桥术等。对巨大左心室、心脏瓣膜病合并心内膜炎、合并多器官功能不全的患者手术综合性治疗获得丰富经验，使众多过去认为无法手术及治疗的患者重新获得生机，在社会上引起了极大的反响。近年来冠心病外科得到快速发展，常规开展的项目有：非体外循环下冠脉搭桥术、微创心脏不停跳冠脉搭桥术、急诊冠脉搭桥术、冠脉搭桥术同期行瓣膜置换术或成形术等。
　　大血管方面大血管疾病是心胸外科疾病的头号定时炸弹，患者可能在任何时刻突发死亡。大血管手术是心胸外科风险最高、难度最大、创伤最大的手术。近几年我科在大动脉瘤的外科手术与介入治疗方面取得了迅速发展，成为学科发展的新增长点。先后成功开展了主动脉夹层的腔内隔绝治疗技术，减小了患者的手术痛苦，加速了术后康复，大大提高大血管疾病的治疗效果，成为部分主动脉疾病的首选治疗方式。同时，对于那些不能采用单纯腔内隔绝治疗的患者，我科积极开展国际最新的腔内隔绝与开放手术相结合的“杂交”技术，努力使大血管外科朝着减小创伤、加速康复的方向发展，提高大血管疾病的综合治疗效果。
　　　微创手术方面我科在上世纪90年代即开展胸腔镜手术，是省内较早开展的科室，作为我科的专业特色，近年来，我们已成功地将这一微创手术应用于自发性气胸、肺良性肿瘤、早期肺癌、恶性胸水、手汗症等疾病的诊断和治疗，其手术适应征涵盖了大部分普胸疾病，包括：1．肺部疾病：早中期肺癌、气胸、肺结节、肺良性肿瘤、肺气肿、支气管扩张症；2．食管疾病：早中期食管癌、食管平滑肌瘤、贲门失驰缓症、胃-食管返流性疾病、食管囊肿、胃食管交界处肿瘤； 3.胸膜疾病：早期脓胸、恶性胸水、胸膜良性肿瘤； 4.纵隔疾病：纵隔良性肿瘤、 重症肌无力、畸胎瘤、各种纵隔囊肿；5.自主神经疾病：原发性手汗症。6.胸壁疾病：漏斗胸。胸腔镜微创手术与传统开胸手术相比，不仅手术效果相同，还具有创伤小、疼痛轻、恢复快、美观、保存了患者的免疫力等优点。