南京医科大学第二附属医院神经外科是省内较早开展神经外科常规手术的科室,该科现拥有床位23张（含6张监护床），近期床位将扩大至40张。医生7人，副主任医师以上人员3名。博士2名，余均硕士学历。科室拥用先进的手术显微镜,配套显微器械,颅底神经内镜以及价值近200万元人民币的“细胞刀”,使该科在省内较早进入显微神经外科时代,科室在治疗脑血管病，颅内脊髓各类肿瘤方面进入了微创时代,特别是在颅内动脉瘤的手术治疗达到了国内先进水平,并率先在省内开展颅底神经内镜应用。此外三叉神经痛，帕金森氏病，癫痫病都在这时得到了准确治疗。在科主任,学科带头人李英斌教授的带领下,科室与美国,法国,韩国等国神经外科基地建立了长期联系。