神经内科（本部）是集医疗、教学、科研为一体的脑血管疾病及神经系统各疾病诊疗中心；是江苏省临床重点专科、南京医科大学教学示范基地，中华医学会江苏省神经病学会、江苏省及南京市医疗事故鉴定委员会成员单位。2011年被国家批准为医院首批GCP单位。科室有主任医师、副主任医师、主治医师及住院医师等完善的医疗队伍，也是医院优质护理单元。病房设施齐全，每个房间均配备有卫生间。
　　科室配备有脑电图、肌电图、经颅多普勒超声脑血流仪等完善的神经电生理检查设备，还配备有脑脊液细胞学检查，高压氧治疗室等。相关大型设备有磁共振、螺旋CT、多排CT、DSA、SPECT，彩超等。能满足神经科各种疾病诊断治疗的需求。
　　病房：重点收治缺血性脑卒中（脑梗死）病人。重点开展急性脑梗死的早期溶栓治疗、介入诊断治疗、早期康复、中西医结合治疗等。同时收治颅内出血、帕金森病、癫痫、中枢神经系统感染、神经系统自身免疫性疾病、神经炎、肌病以及各种原因导致的神经系统损害等。
　　医疗特色：急性脑梗死的超早期溶栓，恶性大面积脑梗死的的抢救，帕金森病的系统化诊断治疗，脑脊液细胞学监控下中枢神经系统感染的诊断、治疗及疗效判断。神经科疑难杂症的诊断及鉴别诊断。