胸外科为南京市重点专科，该科有合理的人才梯队和过硬的专业技术，具有胸腔镜、纤维支气管镜、便携式血气分析仪等专科设备，并承担南京医科大学教学、实习任务。现拥有专科医师5人，其中主任医师1人、副主任医师2人、主治医师2人，硕士研究生1人。现已常规开展胸段上、中、下食管癌根治切除术、消化道重建术、贲门癌根治切除术、肺癌根治切除术、支气管肺癌袖状切除术、纵隔肿瘤切除术、复杂重大胸外科抢救、胸腔积液诊断治疗、胸壁肿瘤诊断治疗。近年来又陆续开展了胸部微创治疗、胸腔镜肺大疱切除术、肺气肿肺减容术、周边肺结节胸腔镜下切除活检术、早期肺癌微创肺叶切除术、早期食管癌胸腔镜根治切除、顽固性胸腔积液诊断治疗。胸外科医护人员在胸部手术的围手术期处理上已积累了一定的理论和实践经验，尤其在术前评估和术后并发症的防治上已经取得同级医疗机构中的领先水平，极大的提高了手术的安全性，减少了手术的风险，从而有利于病患手术预后。