中医肛肠科成立于2002年，病房现位于一住院楼10楼，开放床位62张，年门诊量11000余人次，年住院量1500余人，年手术量1600台。具有舒适的医疗环境，先进的诊治设备、经验丰富的临床专家以及严谨务实的工作团队共同打造成湘南地区规模最大、设备技术精良、人才优秀的肛肠病治疗中心。
1、人员结构
　　现有医务人员23人，其中高级职称3人 ，硕士导师1人，主任医师1人，副主任医师2人，主治医师4人，住院医师1人，麻醉师1人；其中硕士研究生7人。
2、学术地位
　　刘少琼，中医肛肠科学科带头人、主任医师、教授、硕士研究生导师、全国中医肛肠学科名专家。从事医学专业三十余年，1997年被湖南省卫生厅确定为衡阳市中医肛肠学科带头人。2000年自研制的复方芙蓉花叶栓治疗肛肠病被衡阳市中医院作为常规药物临床应用至今；主持完成湖南省厅级科研课题2项。2002年开展了小儿肛肠外科手术，填补了衡阳市小儿肛肠外科手术的空白2003年创建了南华大学第一附属医院肛肠病治疗中心，并担任肛肠病治疗中心副主任，主要负责主持医院肛肠病治疗中心工作。
3、医疗范围
　　如（ 痔、肛裂、肛周脓肿、肛瘘、直肠息肉、直肠前突、直肠脱垂、肛门癣、肛乳头炎、肛门毛囊炎、直肠阴道瘘、肛门接触性皮炎、肛周湿疹、肛周尖锐湿疣、肛门瘙痒症、肛周神经性皮炎、肛周皮肤结核、肛门直肠损伤、肛门闭锁、直肠内异物、先天性肛门直肠狭窄、肛门失禁、肛门直肠先天畸形）等20余种肛肠疾病。
4、科研成果
　　主持的课题：2006年获得主持省国家中医药管理局课题：“不同证型溃疡性患者肠黏膜TH1/HT2表达的研究”（湖南省卫生厅中医药科研基金项目 NO:204063）。2004年参与省教育厅课题：“乌白丸对大鼠实验性溃疡性结肠炎细胞因子影响的研究”。2011年主持省教育厅课题：“从Notch信号途径探讨姜黄素对大肠癌细胞增殖和凋亡的影响及作用机制”。培养研究生数4人，近几年在各级刊物上发表论文近20余篇。获得各类科研基金10项。