1983年传染科正式成立，2003年更名为感染科。学科历经30余年的发展，现为湘南地区唯一培养传染病研究生的硕士授予点；是国家SFDA认证的感染病专业国家临床药物试验基地；是中国肝炎防治基金会主办“2010全国肝纤维化知识竞赛”武汉大区赛冠军、全国总决赛季军获得者；是湘南地区平均学历最高、技术力量最雄厚的感染内科。学科构建以“肝病为龙头、感染性疾病为中心、危重症抢救为重心”的科室特色。
　　感染科包括门诊、住院病区、肝病研究中心和人工肝治疗室。门诊包括专家门诊、肝炎门诊、发热（普通）门诊、腹泻门诊、感染科B超与Fibro Touch影像引导无创肝纤维化检测系统。住院部 现有病床72张，两层病房分为肝病病区、非肝病病区、监护病区。肝病研究中心设有免疫研究室、基因诊断分子生物研究室，其中临床基因扩增实验室能开展最新肝病的基因检测及手足口病等病原学诊断与科研工作。人工肝治疗室拥有日产PlasautoiQ型及 ACH-10型持续徐缓式血液滤过装置进行人工肝支持系统治疗。
1、人员结构
　　科室现有医师14人，其中主任医师（教授）2人、副主任医师（副教授）2人、主治医师7人；博士学位2人、硕士学位9人、硕士研究生导师2名。技师2人，其中副主任技师1人、主管技师1人。护理人员30余人，其中副主任护师1名，主管护师8名。
2、学术地位
　　感染科拥有一只高素质、高水平的医疗、教学、科研、预防队伍，是湘南地区感染性疾病诊疗的领头羊。科室专家担任了中国医师协会感染科医师分会全国委员、中国医师协会中西医结合医师分会肝病专家委员会委员、全国肝胆病咨询专家、全国疑难及重症肝病攻关协作组成员；湖南省肝病学会副主任委员、湖南省肝病学会药物性肝损伤学组副组长、湖南省中西医结合学会感染病学会副主任委员、衡阳市感染病学会主任委员、秘书、衡阳市肝病学会副主任委员、衡阳市结核病学会副主任委员及秘书、衡阳市突发事件卫生应急专家咨询委员会副主任委员；湖南感染病学专业委员会委员，湖南省微生态学专业委员会委员，湖南省自然科学基金评审专家库成员、湖南省综合评标专家库成员、湖南省医学会预防接种异常反应鉴定专家库成员；以及《肝博士》等学术期刊编委。
3、医疗范围
1）肝病方向：各种原因所致急慢性肝病，特别是病毒性肝炎、肝硬化、肝功能衰竭、脂肪肝、药物性肝损伤，以及黄疸查因、转氨酶升高查因等；
2）结核病方向：各型肺结核及肺外结核（包括结核性胸膜炎、结核性脑膜脑炎、支气管内膜结核等）；
3）急性传染病及新发感染性疾病：手足口病、流行性出血热、麻疹及水痘等急性出疹性疾病、腮腺炎、霍乱及细菌性痢疾等感染性腹泻、钩体病、破伤风、禽流感等；
4）其他严重感染性疾病：如病原体相关脓毒血症、感染性休克、重症病毒感染等；
5）不明原因发热：包括诊治各种发热原因未明者及其他难治性感染等；
6）精准病原学诊断：乙肝病毒、丙肝病毒、手足口病毒、EB病毒、肺炎支原体、巨细胞病毒等基因诊断，结核感染γ干扰素释放试验辅助诊断结核病。
4、医疗特长
　　对治疗各类型急慢性肝炎、重型肝炎、（失）代偿期肝硬化、脂肪肝等其他肝病、结核病、肾综合征出血热、发热待查、感染性腹泻、急性出疹性疾病、病原体相关脓毒血症、手足口病等其他新发感染性疾病有着丰富的临床经验和很高的抢救成功率。
　　在病毒性肝炎相关肝病的个体化与优化治疗：即慢性乙型肝炎抗病毒治疗与耐药监测、丙型肝炎病毒基因分型与慢性丙型肝炎抗病毒治疗、人工肝等综合治疗重型肝炎、瞬时弹性成像无创诊断肝纤维化及其中西医结合治疗；不明原因发热和新发感染性疾病的诊治、介入治疗肺结核大出血等系本科医疗特色。承担医院抗菌药物应用会诊任务，积极倡导精准治疗和推动多学科合作，为难治性感染、耐药菌感染等患者，提供最佳诊疗实践。
5、科研成果
　　科室人员近年来主持或主要参与国家、省市级科研课题10余项，在国际、国内重要学术期刊发表学术论文发表医学论文近30篇，有多篇论文在欧洲肝脏研究学会、美国肝脏疾病研究学会、亚太肝病研究学会、北京地坛国际感染病会议等国际性肝病与感染病学术会议交流。主编专著《乡村医师诊疗常规：传染病诊疗常规》与《病毒性肝炎》2部，参编《医学生医患沟通教程》等专著2部。
6、教学成果
　　已毕业优秀研究生近20人，在读研究生近10人，一直承担南华大学本科、研究生《传染病学》的教学及住院医师规范化培训工作以及县级医院医师的进修指导工作。是中国肝炎防治基金会主办“2010全国肝纤维化知识竞赛”武汉大区赛冠军、全国总决赛季军获得者，是南华大学优秀教研室。传染病学课程是南华大学课程考核质量评价优秀课程，是南华大学附一医院教学比武一等奖获得单位。多位老师获“南华大学优秀教师”、“南华大学教师课堂教学奖”、“南华大学青年教师课堂教学比赛十佳临床教学能手”等荣誉称号。