南方医科大学深圳医院是深圳市医疗卫生“三名工程”的重大项目，由深圳市政府按照“三级甲等”医院标准投资兴建的大型市属公立医院，是南方医科大学第六所直属附属医院。
　　南方医科大学深圳医院眼科荟萃了来自全国各地的高学历、临床经验丰富的专业技术人才，现有主任医师2人，副主任医师2人，教授1人，副教授2人，硕士生导师3人；其中具有博士学位者3人，硕士学位者4人，有海外留学经历者3人。
　　科室目前已经配置了多种性能先进的临床诊疗设备，拥有德国蔡司公司生产的Humphrey II-I 全自动视野检查仪、OPMI Lumera i型手术显微镜、VISULAS眼底及眼前节YAG激光治疗仪、生物测量仪IOLMaster，日本拓普康公司生产的数码裂隙灯显微镜、SP-3000P角膜内皮计数仪，日本Canon TX-20P 非接触式眼压计，美国爱尔康公司生产的Laureate白内障超声乳化治疗仪，意大利CSO 角膜地形图仪，尼德克公司综合验光仪，眼科A/B超、OCT、弱视治疗仪等一大批世界先进的诊疗设备，紧跟国内外先进诊疗技术，不断开展新业务、新技术，在多方面形成了特色优势。
　　眼科将开设病床30张，设立眼外伤、眼表角膜病、白内障、青光眼、视网膜病、眼肌与屈光、眼眶病与眼肿瘤及准分子激光角膜屈光手术中心等专科门诊，能进行眼科各种大中型手术，如白内障超声乳化摘除联合人工晶体植入、白内障超声乳化摘除联合人工晶体植入和青光眼小梁切除术、复合式青光眼小梁切除、复杂性青光眼前房引流阀植入、老年性黄斑变性视网膜下新生血管和视网膜、玻璃体出血等眼内注射抗新生血管药物治疗、眼化学伤羊膜移植、角膜缘干细胞移植、睑球粘连松解结膜囊形成、穿透性角膜移植和板层角膜移植、眼睑肿瘤切除联合眼睑成形术、眶内肿瘤摘除、眼球摘除联合义眼台植入、糖尿病视网膜病变等的眼底激光治疗、慢性泪囊炎泪道阻塞的激光再通及鼻腔泪道逆行置管术、屈光不正矫正、斜视矫正、弱视康复治疗等多种眼科手术及疑难、复杂疾病的诊断和治疗。
　　眼科现有医师中已先后获得了国家自然科学基金、省自然科学基金、省科技计划基金、深圳市科技创新委员会、深圳市科工贸信委员会科技基金资助课题等10余项，分别在国际著名眼科学术期刊《Invest Ophthalmol Vis Sci》、《Molecular Vision》、《J .Cataract Refract Surg》、《Graefes Arch Clin Exp Ophthalmol》及国家级医学核心期刊《中华眼科杂志》、《中华眼底病杂志》、《中华眼外伤和职业病杂志》、《中国实用眼科杂志》等杂志发表学术论文100余篇。获得省级科技进步奖二等奖一项，担任副主编和编委出版《中西医角膜病学》、《眼表疾病的理论基础与临床》、《简明眼科手术学》及《眼部新生血管性疾病》等大型眼科学术专著6部，培养毕业硕士研究生12人，并多次负责举办广东省和深圳市眼科继续教育学习班。