传染病科是国家重点投资兴建的渝西片区的传染病防治中心，担负着渝西片区传染病的防治任务。

该科成立于1962年，改革开放以来，在感染性疾病与传染病的诊治及临床研究方面取得了显著成绩。科室协助重庆医科大学国家抗生素临床研究基地完成了10多项国家级新药的临床研究。流行性出血热研究的成果，被载入《中国内科年鉴》，多次荣获省市科技成果奖。

科室现有医务人员20名，其中高级职称医师4名。国家投资600余万元新建成的传染病大楼，开放床位60张，宁静温馨的病房，设备先进的重症监护室，为传染病诊治创造了良好条件。 传染科主要诊治：肝炎(包括乙型、丙型、甲型等类型)，肝硬化，肝脓肿，发热性疾病 (包括病毒、支原体、螺旋体、细菌、寄生虫等引起的全身或局部感染)，流行性脑脊髓膜炎，乙型脑炎，结核病，菌痢、霍乱及其它腹泻，其它可疑传染病或原因不明的感染性疾病。