南昌大学第二附属医院于1960年成立A超室，在省内首家开展了A型超声波的检查。1978年开展了M型超声心动图检查，用于风湿性心脏病、冠心病及心律失常等疾病的诊断，以及心包积液的测量。1982年B超室成立，开展B型超声波和二维超声心动图检查。1987年江西省医学会超声医学专业委员会成立，学会挂靠于我院，科室为全省超声医学的发展作出了积极的努力，包括当时受卫生厅委托每年开办两期超声学习班，每期学习班安排理论授课等。1988年医院购进具有穿刺引导功能探头的B超仪，从此开展了B超引导下的介入性超声工作。1989年成立了彩超室，医院引进美国ATL公司的ULTRAMARK－超6型彩色多普勒超声诊断仪，在省内率先开展彩色多普勒超声检查。1998年购置美国PHILIPS ATL-5000型彩色多普勒超声诊断仪，并配置了MPT7-4多平面经食管超声心动图探头，在省内率先开展了经食管超声心动图技术，用于复杂疑难心血管疾病的诊断。1995年开始招收硕士研究生，现已培养硕士研究生26人，他们在各自的岗位上、在医教研的工作中发挥了骨干带头作用，个人取得长足的进步与发展。超声科于2001年正式独立建科，经过50余年的建设与发展，现已成为集医疗、教学和科研为一体的专业学科。
　　科室拥有一支优秀的专业技术团队，现有超声医师22人，中青年技术骨干占2/3以上。其中硕士学历14人；高级职称8人；博士生导师1人，硕士生导师3人。省卫生厅学科和技术带头人培养对象1人。科室技术力量雄厚，一直以来是江西省超声医学人才的进修培训基地，也是复杂疑难疾病的超声会诊中心。
　　科室仪器设备先进，目前拥有中高档彩色多普勒超声诊断仪16台。超声探头配置齐全，除常规心脏、腹部、浅表器官探头外，还配备专用的经食管探头、经阴道经直肠探头、穿刺探头及三维超声探头，完全满足了临床各个专业学科的诊治需求。
　　良好的学科梯队，严谨求实的作风，以病人为中心的服务理念，使超声科成为省内同一领域的领军学科，2009年被江西省卫生厅评为省医学领先专业学科。