牡丹江红旗医院消化病内镜诊疗中心最早自70年代起就作为独立科系，专门出生诊断治疗食管胃肠、肝胆、胰腺及腹膜等消化系统疾病，三十多年来消化科的医护人员正确诊断治疗了数以万计的食管炎、食管溃疡、食管癌、胃炎、胃十二指肠溃疡、肠炎、肝炎、肝硬化、肝癌、胆囊炎、胆结石、胰腺炎、腹膜炎等消化系统疾病；抢救成功了数千例急性上下消化道出血伴失血性休克、肝性脑病等急危重症病人，目前在上述疾病治疗方面能与国内医学先进水平接轨，消化科于70年代初最先在市内开展纤维胃肠镜检查胃镜下食管静脉曲张硬化治疗；90年代初最先在市内开展电子胃肠镜检查胃镜快速诊断幽门螺杆菌、内镜下高频电凝电切胃肠道息肉、胃内取异物，C-尿素呼气实验无痛苦诊断幽门螺杆菌感染，无水酒精肝肿瘤内注射治疗原发性肝癌、无水酒精囊肿内注入治疗肝囊肿等；在市内领先开展了无痛胃肠镜检查与治疗，经十二指肠镜逆行胰胆管造影（ERCP）诊断，经十二指肠镜十二指肠乳头切开术、胆总管取石和胆管引流术、胆管支架置入术等内镜国介入治疗，经皮经肝穿刺胆管造影引流及支架置入、食管狭窄扩张及支架置入等介入治疗，使许多患者免除手术的痛苦。