感染性疾病科是莲花县唯一的感染性疾病临床诊疗科室，拥有独立的住院楼、设有发热门诊、肠道门诊、肝病门诊、VCT咨询室、专科化验室、治疗室。病床16张，现有副主任医师2名、专科医师3名，承担该县的各类疾病突发事件、法定传染病的管理工作。如各种原因引起的肝炎，肝炎后肝硬化、结核病（肺结核、结核性胸膜炎、结脑）痢疾、感染性腹泻等常见传染病的预防、医疗、科研、教学工作。对慢性肝炎能正确的诊断，全程规范化的抗纤维化、抗病毒治疗，对肝病病友进行科学的健康指导、妊娠期（孕妇）肝病及母婴阻断治疗，在处理结核病人的抗痨过程中出现的肝损害方面有所专长，及时正确处理结核病耐药问题。长期同县疾控中心合作，在县卫生局的领导下，在抗击非典、人禽流感、手足口病的筛查、防治方面发挥重大作用。