吉林大学中日联谊医院泌尿外科创建于1949年，是该省成立最早，规模最大，专科技术最齐全的泌尿外科，现为吉林省、长春市、院重点学科，现任科主任孔祥波教授。目前科室开放床位150张，拥有博士生导师3人，硕士生导师4人，副高以上专家9人。科室拥有吉林省肾脏移植与血液净化研究中心，吉林省前列腺疾病防治中心，吉林省卫生厅泌尿系肿瘤重点实验室等研究中心，并设立博士后流动站，在综合专业技术水平、微创腔镜技术、基础研究能力、诊疗设备设施等各个方面始终保持吉林省领先地位。2005年吉林省率先开展泌尿系结石微创腔镜治疗。2014年省内率先开展输尿管软镜治疗上尿路结石，1989年吉林省率先开展前列腺经尿道电切术,2000年率先开展后腹腔镜技术治疗肾上腺肿瘤及肾肿瘤根治术,2010年开展腹腔镜前列腺癌根治术及膀胱癌根治术。
　　四年来，在现任学科带头人孔祥波教授的带领下，通过科学高效的管理体系，加强学科建设的人才培养，建设并完善科室文化，科室的综合能力取得长足的进步。临床方面，在泌尿系肿瘤、泌尿系结石的微创治疗方面继续保持国内先进、省内领先的优势，微创手术占手术总例数比例不断加大；年均住院病人4000余人，手术3000余例，经皮肾镜碎石术输尿管软镜等微创手术占总手术例数的85%-90%。输尿管软镜、经皮肾镜，腹腔镜前列腺切除术、肾癌根治术、膀胱全切术等均处于国内领先地位。科研方面，科室共发表SCI文章20余篇，申请国家、省、市课题项目多项，课题资金共200余万元。尤为可喜的是，2012年，在孔祥波教授主持下，该科在申请卫生部国家重点专科建设项目中取得成功，成为全国泌尿外科30个国家重点建设专科之一，获得1000万元项目资助。
　　学科带头人孔祥波教授是国内知名的泌尿外科专家，是该省泌尿外科微创治疗的开拓者和奠基人，现担任中华医学会泌尿外科分会委员，吉林省长春市泌尿外科学分会主任委员，医德高尚，医术精湛，在该省享有很高的威望和知名度。在孔祥波教授的带领下，科室坚持“科有特点，人有专长”的发展规划，通过这四年的努力，已成立泌尿系肿瘤、结石、前列腺疾病、男科、尿控、小儿泌尿6个人才梯队合理的亚专业学组，整体诊治水平居国内领先。