吉林大学第二医院中医科始建于1958年，科内曾汇集了尚明斋、高升三、李学中等多位省内外知名老中医，在中医肝病、肾病、男性病、风湿病及老年病的治疗上富有特色。中医科现有教授1人，副教授3人，主治医师2人，医师1人，其中国家级专家1人，省级专家2人，硕士研究生导师2人，开设评价中药房，以传统方法代煎中药，加工中药散剂。
　　中医科先后承担了白求恩医学部临床医学五年制、七年制、口腔专业、妇幼、护理以及留学生班的中医教学工作，近年完成省级科研课题7项，厅局级课题2项，发表大量的专业论文，其中有SCI论文数篇，编写学术专著10余部，并先后担任全国高等学校规划教材《中医学》主编及编委，获吉林省科学技术进步三等奖1项，吉林省自然科学学术成果奖2项。
　　近年来国家级专家、吉林省名中医高鹏翔教授采用传统的中医药疗法，在中医高热急症、肝硬化腹水、肾病、肿瘤、皮肤病等治疗上取得显著疗效。省级专家、长春市名中医、硕士研究生导师刘臣主任在中医妇科疾病、甲状腺疾病、内科杂病、皮肤病、眼科疾病的治疗上经验丰富。
　　中医科现开设：疑难病专诊、更年期综合征专诊、失眠症专诊、风湿病专诊、皮肤病专诊。
　　疑难病专诊：
　　国家级专家、吉林省名中医高鹏翔教授在治疗急症高热、肿瘤、肾病、肝硬化腹水等疑难病方面有丰富的临床经验，采用中医药治疗各种高热具有较好的疗效，在省内处于领先地位，用用中医药治疗中晚期肿瘤，采用扶正固本、活血化瘀等手法，有效的提高了肿瘤患者的生存率及生活质量，在广大患者中享有较高的声誉。同时以通腑温阳化瘀、和中祛邪并举法治疗慢性肾功能不全，肝硬化腹水有效率达85%。
　　更年期综合征专诊：
　　更年期综合征又称为围绝经期综合征，目前发病率高达85%左右，其症状繁多，如烘热汗出、烦躁易怒或抑郁焦虑、失眠、头晕头痛、血压升高、心慌气短、腰膝酸痛等，严重影响妇女的生活质量，我科根据该病病机：肝肾俱亏、瘀血湿热夹杂，创立鳖龙汤（冲剂），并在吉林省中医药管理局、长春市科技局立项，临床观察治疗数千例患者，临床疗效显著。
　　失眠症专诊：
　　失眠困扰着众多的企业家、白领、脑力劳动者、中老年人，长期服用安眠药容易产生成瘾性、耐药性、毒性，我科采用通腑泻热、养血平肝、重镇安神、活血化瘀等多种疗法，以中药口服、静点、穴位贴敷多种方法治疗失眠症，具有疗效可靠，无毒副作用的特点。
　　皮肤病专诊：
　　中医药在治疗皮肤病方面有着悠久的历史和良好的疗效，我科采用中药内服、外洗等方法治疗顽固性荨麻疹、痤疮（粉刺）、脂溢性皮炎、银屑病、湿疹、神经性皮炎、黄褐斑有较好疗效。
　　教学工作：中医科先后完成了临床医学、口腔医学、妇幼专业、读书情报等几十个年级的中医教学任务；自1980年以来，先后接待了二批日本研修生来科学习，并接待了日本、韩国、台湾省的留学生20多名，来科学习中医。
　　先后承担了韩国留学生的《中医基础学》、《伤寒论》、《针灸学》、《中医内科学》、《医古文》等教学700余学时。能较好地完成国内外本科生、专科生、留学生的各项教学任务、受到学生们的好评。
　　科室自1980年以来，开始培养硕士研究生，均学有所成，在各自的工作岗位上，做出应有的贡献。科室有6名同志先后赴日本、韩国进行学术交流和研修，为促进国际学术交流做出了卓越的贡献。
　　科研工作：四十余年来，科室先后在国内外医学杂志上发表学术论文120余篇；参加编写出版学术著作14部，其中主编4部、副主编3部、编委7部；参加编写卫生部规划教材3部。
　　自1986年以来，科室先后完成科研新药研究成果6项，有的已经收到丰厚地经济效益和社会效益。
　　二院中医科有悠久地历史，及较好地学科基础。五十余年来，在医、教、研方面，做了大量的工作。但是由于近几年，科内的部分老专家相继离退休，科室的发展受到一定影响，科室目前重点抓中青年梯队的人才培养，突出专科专病特色，尽快使中青年医师成为学有专长，技有特色的人才，扩大知名度。
　　二院中医科今后发展的方面，是在发挥优势及特色的基础础上，结合现代的科技手段，运用中西医结合方法，主攻中医治疗急症、高热、风湿病、肿瘤等疑难病症。