该院脾胃肝胆病科（原消化科）是国家临床重点专科、国家中医药管理局中医诊治消化系统疾病的重点专科，省级中医诊治胃肠和肝胆胰腺疾病的特色专科(其中消化性溃疡为省级重点中医专病，肝硬化为院级重点专病)，并为血吸虫肝病国家级平台建设单位，江西省中医肝病及脾胃病学术研究牵头单位。该科是以中医和中西医结合的方法研究和诊治消化系统疾病的、有明显中医和中西结合特色的科室，开放床位60张，年收治患者1600余人次。
　　全科共有医生17名，其中主任中医师/教授6名、副主任中医师5名、主治医师2名、住院医师3名，专业灸疗师1名，具有博士学位者3名、硕士学位者7名，科室的骨干力量都是国内、省内脾胃肝胆病专家，主持多项国家及省级课题，对慢性肝胆病和慢性胃肠病的中医特色研究始终走在全省乃至全国同行业的前列，主要运用中医及中西结合的手段和方法诊治胃肠肝胆疾病，包括：各种急、慢性肝炎，肝硬化(含血吸虫肝病)，各种顽固性腹水，急、慢性胆囊炎，胆石病，急、慢性胰腺炎，食管炎，胃炎，胃癌前期病变，胃、十二指肠溃疡消化道出血，溃疡性肠炎，各种原因所致的慢性腹泻，功能性消化不良，以及各种寄生虫病(省寄生虫病研究所临床部挂靠该科室)等。在此基础上，制定了常见病及优势病种诊疗方案，配合具有该科特色的辨证施护，使该类疾病患者在该科就诊时能享受到具有该科特色的诊治服务。
　　该科在几代医务人员的辛勤探索下，摸索出多种中医特色疗法及专方专药，为该科治疗胃脘痛、水臌、呕血/便血提供了许多有效手段，并具有多项学术创新，如热敏灸在胃脘痛和水臌的运用、中药灌肠治疗水臌及胃镜下喷洒中药治疗呕血/便血等。同时开展消化内镜介入治疗，如胃肠息肉高频电凝电切术，食管静脉曲张圈套结扎术，经内镜逆行胰胆管造影术，经内镜下乳头括约肌切开胆管取石术等治疗；并在省内首先应用肝脏弹性检测仪开展无创性肝脏组织评估等技术，应用现代化的手段为中医服务，中西医结合，拓宽了中医治疗疾病的范围，更好的服务于临床，使更多患者受益。