感染科（原传染科）建立于1987年，是省内唯一的儿童感染专科。担负着全市儿童传染性疾病的医疗及预防，还承担着全省各个地、市及周边省份本科危重病人的院前急救转运及医疗任务。通过10多年的探索，形成了一套科学健全的医疗护理常规和管理程序。
感染科为一独立的三层楼建筑物，一楼为门诊，分肠道门诊、发热门诊和呼吸道门诊，设留观床位12张，配有专门的注射室，治疗室，药房，检验室及收费室。既方便病人，又有利于隔离病人，防范交叉感染。二、三楼为病房，二楼为呼吸道病房，三楼为消化道病房，床位50张，每个房间内配有闭路电视，空调，暖气，热水，厕所，电子灭菌仪及床前呼叫系统。
感染科有一支专业稳定、技术全面的技术队伍，全科有专业技术人员24名，其中资深专家1名，主任医师2名，副主任医师1名，中级卫生技术人员6名，研究生2名。科内配备有先进的治疗、监护及抢救设备，包括心电监护仪，呼吸机，输液泵等，备有床旁心电图，微量血糖监护仪，经皮治疗仪等。
近几年，科室业务飞速发展，年门诊病人15000人次左右，年收治住院病人达1200多人次，收治病种多。在儿童感染性疾病，特别是传染病的诊治和护理有丰富的临床经验，如乙脑、结脑等颅内感染的治愈率达到国内水平，尤其在降低后遗症方面有经验；婴儿肝炎综合征治疗方面也有丰富的临床经验。
近年来，科室发展重点放在攻克儿童肝炎和结核这两方面。
在儿童慢性乙型肝炎治疗方面，开展了多项新技术，率先在省内应用干扰素及联合乙肝疫苗治疗儿童乙型肝炎，取得了较好的成绩，有多篇论文发表。在儿童使用干扰素方面积累了丰富的经验。今年又以儿童乙型肝炎作为重点专科，治疗上与国际接轨，率先在国内儿童中使用拉米夫定，取得了较为满意的效果。
结核病严重危害儿童的心身健康，而结核病的快速准确诊断，是控制结核病的重要措施。目前，结核菌素试验（TST）是诊断典型与不典型儿童结核的最重要的甚至是不可缺少的唯一条件，但经典的PPD试验对结核病的诊断特异性差，不能排除BCG接种和非结核分枝杆菌感染。受机体免疫抑制影响，致使儿童结核易误诊、漏诊。为了探讨一种早期快速诊断结核的特异性方法，我科开展了ESAT-6早期诊断结核感染的课题的研究。该项试验在国内尚未开展，填补了国内空白。