北医科大学第二医院1952年设胸外科专业，1998年胸外科成为以诊治胸部肿瘤为重点的综合性独立科室。以张合林教授为学科带头人的胸外科全体同仁近来逐步开展了多项高难度手术，如：在河北省首先开展的局部晚期肺癌根治及左心房部分切除术、食管癌根治及部分受侵主动脉壁切除术、单操作孔胸腔镜下胸腺切除术治疗重症肌无力等技术为国内先进，河北省领先水平。
　　胸外科拥有一支30多人高素质的医疗团队，包其中高级职称人员7人，医学博士2人、医学硕士6。拥有重症监护病房，电子支气管镜，肺癌肿瘤射频消融机，冷冻治疗机，西门子智能呼吸机等现代化设备。近年来胸外科成功开展了十余项高难度手术、临床技术创新和新技术应用，多项为河北省首例、河北省领先水平。目前开放病床45张，每年甲类手术350余台次，年住院病人近2000人次。胸外科医术精湛，医德高尚，全心全意为广大患者提供优质、人性化的医疗服务。
　　胸外科收治食道癌，食管良性肿瘤，肺癌，肺转移性肿瘤，肺和支气管肿瘤，肺或支气管良性肿瘤，纵隔肿瘤，胸壁肿瘤，肺气肿，气管疾病，胸膜疾病，食管疾病，胸壁疾病，胸腔积液，气胸，血胸，纵隔疾病，膈肌疾病，胸部创伤，肺心病，重症肌无力，贲门失驰症，闭合性气胸，创伤性窒息，非特异性肋软骨炎，肺爆震伤，肺大疱，肺动静脉瘘，肺棘球蚴病，腐蚀性食管灼伤，膈上憩室，急性脓胸，开放性气胸，漏斗胸，慢性脓胸，脓胸，食管憩室，食管中段憩室，胸壁结核，胸腹联合伤，张力性气胸，支气管腺瘤，小细胞肺癌胸腺瘤。
　　科室进行肺叶切除，全肺切除，心包内全肺切除，贲门癌根治术，食管胸中下段癌根治弓上弓下吻合术，食管胸上段癌根治颈部吻合术（三切口），纵隔肿瘤摘除术；较难度手术:气管支气管的隆凸成型术，袖状切除术肺癌根治性切除，左心房部分切除术，食管内翻剥脱结肠代食管术，食管狭窄胸骨后结肠转流术，巨大纵隔肿瘤摘除术，Nuss手术治疗漏斗胸，支架治疗、放射粒子植入、肿瘤射频治疗、生物治疗等。