药学部前身为民国9年（1920年）2月直隶公立医学专门学校附属医院成立的药局，1952年成立药剂科，逐步建立形成了门诊药房、中药房、中药库和煎药室、住院药房、灭菌制剂室、药检室、普通制剂室、中药制剂室、药库和临床药学小组等。1983年内成立了临床药学组织，创办了内部刊物《临床药讯》；1995年，河北省药品不良反应监察研究中心和河北省临床药学情报信息中心成立并设在药剂科；1998年成立国家临床药理基地（后改名为国家药物临床试验机构），机构设在药剂科；2004年河北省医疗器械不良事件监测中心及河北省药物滥用监测中心成立，办公室设在药剂科。
　　目前，药学部设有临床药学室、药库、门诊西药房、中药房、急诊药房、住院药房、静脉用药集中调配中心等部门，另设有药品不良反应监察中心、药学情报中心、国家药物临床试验机构、卫生部临床药师培训基地等机构，为卫生部抗菌药物监测网首批医院、卫生部合理用药监测网医院、中国药学会医药经济信息网医院、河北省教育厅临床药学教学实训基地。
　　药学部承担着医院药品供应、药事管理、临床用药评价、药物不良反应监测、血药浓度监测、临床药物试验、临床药师培训、临床药理教学、研究生培养、临床药学实验等项工作。
药学部现有职工154人，其中，研究生导师4人，正高级职称11人（占7.1%），副高级职称18人（占11.7%），中级职称47人（占30.5%），初级职称75人（47.8%）；学历构成：博士3人、在读博士1人（占2.6%），硕士27人（占17.5%），本科89人（占57.8%），大专及以下34人（22.1%）。
　　药学部设有临床药学室，负责临床药学相关工作，包括临床药师日常工作、临床药师学员带教培训、临床药理教教学、临床用药咨询、临床危重病例会诊、抗菌药物会诊、用药医嘱点评、处方点评、TDM、临床用药信息提供、ADR监测、出版临床药学简报等。科室于2006年开始实行临床药师制，现配有临床药师14名，其中抗感染专业4名，神经内科专业2名，心血管内科专业2名，ICU专业2名，肿瘤专业2名，肾内专业1名，移植专业1名。临床药师队伍学历层次较高，包括博士1名，硕士8。
　　作为河北省首批卫生部临床药师培训基地，现批准专业共三个，为抗感染药物专业、神经内科专业和心血管内科专业，4名临床药师经过卫生部临床药师培训基地为期一年的正规学习培训，5名经过带教师资培训并获得带教资格，已经招收来自全国各地的临床药师学员3批14名学员。
　　临床药学室设有独立的临床药师办公室、临床药师学员办公室、临床药学学习室、信息资料室及学习室，配备了先进的办公设施和齐全的学习资料，形成了规范的带教学习模式，为临床药师工作的开展和临床药师带教工作的顺利完成创造了良好地工作条件。
　　作为教学医院，建有临床药理教研室，承担临床医学本硕班、临床医学本科班、影像学本科班、护理本科班等学生的《临床药理学》、《临床药物治疗学》教学任务，同时承担药学专业大专班《药理学》教学任务，还承担研究生及本科生临床药学相关学术讲座等工作。科室建有设备齐全的实验室，承担药学专业研究生和本科生的专题带教工作。
　　国家药物临床试验机构批准12个专业，包括I期试验室、心血管内科、呼吸内科、消化内科、血液内科、肾内科、内分泌内科、妇产科、心脏外科、泌尿外科、皮肤科，共完成临床试验项目100余项，包括多项国际多中心研究。