南山医院感染病科是特区西部唯一的传染病专科。我科设备齐全，技术及科研力量雄厚，设有住院床位40张，开有肠道门诊 ，肝炎专科门诊；拥有博士1人，高级职称3人，中级职称2人，肩负着南山区及周边地区各种传染病的临床诊治、教学及科研工作。拥有瑞士罗氏诊断公司实时、定量PCR检测仪，'人工肝'治疗仪及奥地利酶标仪等，已开展'肝穿'及'人工肝'支持治疗等项目，对各型病毒性肝炎、肝硬化及各种原因引起的肝损害（酒精性肝病、药物性肝损害、血吸虫、肝吸虫等）诊断治疗，尤其是重型肝炎的早期治疗具有丰富的临床经验，对重型肝炎的抢救治疗成功率达60%以上，达到国内先进水平。在'发热待查'、'黄疸待查'及难治性感染等疑难杂症的诊断及治疗方面积累了丰富的经验，率先开展乙型肝炎的心理咨询。目前正在进行细菌耐药及丙型肝炎基因治疗的研究。
感染科的服务宗旨是：以病人为中心，用科学的态度，精湛的医术和高尚的医德为患者提供优质的服务，使患者得到及时合理的治疗。