华西医院病理科是全国最大的病理科之一。科室集医疗、教学、科研工作于一体。我科现有在册教职员工64人，其中病理医生/教师30人，9人为教授（主任医师），7人为副教授（副主任医师），14人为讲师（主治医师）；技术人员32人，其中副主任技师1人，主管技师3人，技师28人；工人2人。现有规培住院医师11人，规培住院技师11人，在读硕士和博士研究生30余人，还有30多名来自全国各地的进修医师。
　　病理学教研室承担了华西临床医学院（8年制、7年制、5年制和4年制）、口腔医学院、基础和法医学院的病理学课程的教学任务。针对进修医生和住院医师培训开设了为期一年共120学时的诊断病理学课程的教学任务。还开设了供硕士和博士研究生选择的2门主修课程，如“分子病理学”和“现代组织病理技术”（介绍当代病理学研究技术）。近些年，在教学上获得以下殊荣：“病理学”课程荣获国家级精品课程，并获国家级双语教学示范课程；李甘地教授获国家级教学名师称号；我们的教学团队荣获国家级教学团队。
　　近年来，病理科/病理学教研室有数十项研究课题得到了包括国家自然科学基金和省部级科研基金在内的多项科研基金的资助；在SCI期刊上发表论文近百篇，在中文核心期刊上发表论文数百篇。获得国家级教学成果二等奖，四川省教学成果一等奖，多项四川省科技进步二等、三等奖。获得批准国家发明专利1项。
　　病理科的医疗工作量一直居于全国前列，2012年完成各种病理诊断145,507例，其中组织病理诊断77,417例，细胞病理诊断54,021例，院外会诊7102例。2012年，我科被卫生部医管司授予全国病理远程会诊区域性会诊中心。我科在全国率先开展亚专科病理诊断服务，近年来，为满足日益增长且专科化的医疗服务需要，亚专科的建设和发展迅速，现有淋巴造血系统疾病病理、肾脏疾病病理、肌肉疾病病理、乳腺疾病病理、软组织和骨关节疾病病理、肝脏疾病病理、中枢神经系统疾病病理、泌尿、男生殖系统疾病病理和眼疾病病理等。近年来，我科在分子病理检测方面也快速发展，现已开展诸多检测项目。华西医院病理科现已是国内住院医师和进修医师培训的重要基地，每年招收病理住院医师和技师8~10名，进修医师30余名，其中半数以上的进修医师来自省外。我科在2010年全国首批卫生部国家临床重点专科建设项目的申报中取得终评全国第二名好成绩；在2010和2011年复旦大学医院管理研究所公布的“中国最佳专科声誉排行榜”名列第三名。2011年，我科正式启动了CAP认可准备工作，是目前国内各大型综合医院病理科中首家启动了CAP认可的科室。
　　病理研究室是四川省重点实验室，拥有分子病理学、细胞信号转导与凋亡研究室等实验室。病理研究实验室可为教职员和研究生提供大量的技术支持，包括普通的组织学技术和一些现代实验技术如冰冻切片、免疫组织化学、图像分析、电子显微镜、细胞培养、分子生物学、蛋白质化学及激光捕获显微切割技术。此外，医院还有一些共享设备如共聚焦显微镜、流式细胞术等。长期以来，病理科在软组织病理和淋巴造血组织肿瘤的研究处于国内领先水平。近年来的科学研究工作获得了国家杰出青年基金、国家自然科学基金、973项目、CMB基金等多项资助。近5年来，发表论文335篇，其中SCI/EI论文14篇；主编和参编专著17部。曾获得四川省科技进步一等奖。