华西医院中西医结合科成立于1956年。历经50余年的建设和发展，在临床规模、医疗特色、技术力量、科学研究、教学和人才培养及工作条件等方面已居国内同类学科前茅。是全国综合医院中医药工作示范单位、国家中医药管理局重点学科建设单位、中西医结合一级学科博士学位授权点、四川省重点一级学科、国家药品（中药）临床研究基地和四川省“急性胰腺炎中西医结合防治中心”。获评卫生部国家临床重点专科（中医外科）及国家中医药管理局“十二五”重点专科（中医肺病科）。在2012年教育部一级学科排名中名列全国第四。
　　中西医结合科学科现有在职医师37人，护理人员96人。其中高级职称人员16人，博导4人，四川省名中医8人。有二位国外顶级专家（英国利物浦大学Sutton Robert教授和澳大利亚纽卡斯尔大学Peter Gibson教授）担任科室的客座教授。
　　中西医结合科设病房、门诊、国家中药药品临床研究机构、中药药理研究室等部门。病房现有编制床位218张，其中主院区113张，上锦分院105张。设中西医结合外科、肺病、针灸、肛肠、肿瘤5个临床亚专业。门诊设中西医结合消化、呼吸、针灸、痔瘘、肿瘤、心血管等7个专病门诊。
　　中西医结合学科拥有四个明确、稳定的研究方向：中西医结合治疗重症急性胰腺炎和肠梗阻；慢性阻塞性肺疾病和哮喘的中西医结合防治；循证中医药及其在GCP中的应用；生物方剂分析药理学与毒理学。2010-2012年期间获得纵向科研项目39项，其中国家级项目12项，省部级项目27项，研究经费1369.61万元；发表论文168篇，其中SCI收录63篇，Medline收录21篇；授权专利6项；获得科技成果奖5项。学科近三年横向研究经费近千万元。
　　在长达30多年中西医结合治疗重症急性胰腺炎（SAP）的临床实践中，在《内经》热病理论指导下，以卫气营血和脏腑辨证为基础，独树一帜地提出运用热病气分、血分、脏衰、恢复分期概括本病的证候特点和病机传变规律的热病理论，建立了综合运用益气救阴、活血化瘀、清热解毒、通里攻下四大主要治法治疗该病的辨证论治体系。采用针药结合、中药内服与外敷共用、口服与灌肠同施的多种中医药特色治疗手段，近8年（2003年-2010年）治疗SAP患者3390例，死亡率降低至4%、手术率降低至8.2%，居国内外大宗病案报道的领先水平。同时病员的住院时间缩短，住院费用大幅降低。近5年（2008年-2012年）每年收治胰腺炎患者均超千例且逐年增加，成为国内最大的急性胰腺炎单病种治疗中心。2011年以该方向为依托的中医外科获评为“卫生部国家临床重点专科”，并成为中医药治疗急性胰腺炎的全国协作组牵头单位。
　　针对慢性阻塞性肺疾病（COPD）患者急性加重期和稳定期的不同病机，提出了急性期“清热化痰降气”、稳定期“益气活血补肾”的综合治疗理论；针对哮喘病机，创新性地提出“六淫―哮喘急性发作前窗口期”和“中医证候哮喘表型”的概念及假说，建立了综合防治哮喘的中医药新思路。先后获得四川省科技进步一等奖、卫生部科技进步三等奖、中国中西医结合学会科技进步二等奖、四川省科技进步三等奖等。以本方向为依托的中医肺病科2012年成为国家中医药管理局“十二五”重点专科建设单位。相关研究成果应用于临床实践，使肺心病、肺性脑病的病死率大幅下降。中西医结合治疗COPD、肺心病，弥补了西医治疗手段单一的不足，为治疗个体化、综合治疗开拓了新方法。由于中西医结合疗效优势突出，每年收治的COPD及哮喘患者数稳步增加。
　　针灸在我院已广泛应用于临床各科，并开设有包括中医神经疾病、中医骨伤、中医减肥等多个针灸专科门诊。每年参与住院患者的针灸诊治9万余人次，门诊针灸诊疗1万余人次。在脑血管病与外科围手术期并发症诊治方面优势明显。通过与神经内外科合作，目前建立有从疾病急性期、恢复期与后遗症期一整套相对规范完整的针灸治疗方案，及患者随访数据库，对脑血管病的吞咽困难、二便障碍、肩手综合征、足内翻等棘手的致残主症有较好疗效。通过与外科ICU合作，提出并建立了外科术后患者中西医结合快速康复医疗。现专业以中西医结合学科为平台，以针灸急症治疗研究方向为依托，深度开展中西医多学科交流，学术水平与影响力正稳步发展与提高。
　　中西医结合肛肠是以诊治盆底肛门病为特色的临床亚专业。以“微创、无痛、优效”为理念，独创“分段整形切除治疗环状混合痔”和“切除挂线、断端肌肉固定缝合治疗高位复杂性肛瘘”等国内领先的治疗痔瘘的手术方式。以中药口服，灌肠、穴位注射、结肠灌洗、心理疏导、生物反馈等为手段治疗结直肠慢性炎症、便秘、肛门神经官能症、肛门坠胀等疾病，取得良好的疗效。本专业获批为“四川大学华西医院痔瘘中心”、“四川省重点专科建设单位”和“四川省痔瘘远程会诊中心”。
　　在中西医结合治疗恶性肿瘤的临床实践中，发展和传承出以中医辨证论治为主要纲领，根据肿瘤的中医病机“毒、痰、瘀、虚”，提出了清热解毒、活血化瘀、化痰散结、健脾扶正、益气温阳、扶正固本等治疗法则，拟定了支气管肺癌、肝癌、胃肠癌等中医个体化治疗方案并应用于临床，取得较好的临床效果，延长了患者的生存期。针对联合放化疗阶段，提出“护脾胃扭转枢机，补肾精调阴阳平衡”的诊治思路，针对肿瘤晚期无法进行放化疗治疗的患者，提出“人瘤共存”思想。采用中药内服、穴位贴敷、中药熏蒸、针刺等中医特色方法，减少患者痛苦、提高了生活质量。根据临床经验研制出中药复方“扶正益胃颗粒”、“生髓方”，并获得国家专利证书。
　　中西医结合科融汇中西医术、博采众家之长、恪守“医乃仁术”之训，秉承“学贯中西、结合创新”的科训努力发展学科，竭诚为患者提供优质高效的医疗护理服务。