呼吸专业是儿科医学中心的优势专业，在省内处于领先水平，在国内享有一定知名度。呼吸专业共有主任医生2人，副主任医生1人，副主任护师1人，主治医生3人，住院医生4人，博士1人，硕士生导师2人，硕士7人（医师博硕比例 90%），专职呼吸实验室检验师2人，护士2人（其中专职纤支镜护士1人），拥有优秀的学术梯队。

　　小儿呼吸科儿童哮喘专科门诊是省内最早的专科门诊。采用国际最先进方案治疗小儿哮喘。建立了大量宝贵的哮喘治疗档案。被中华医学会确定“健康呼吸中心”称号；哮喘的质量管理2003年度荣获优秀管理小组称号。

　　2004年在湖南省内率先开展小儿纤支镜术，纤支镜诊断人数在全国位居第五，为全国首先开展儿童镜下介入治疗的四家单位之一。该项技术目前在湖南省内处于领先地位。目前每年完成600-700余例患者（已完成近3000例），所完成纤支镜检查最小年龄患者出生后5小时，2kg。能完成灌洗，活检，取异物，冷冻治疗，球囊扩张等镜下介入治疗，为全国首先开展儿童镜下介入治疗四家单位之一，所完成最小年龄气管异物患者仅5月龄，纤支镜取异物患儿耐受情况好，术后恢复快，能明显缩短住院天数及减少手术费用。且对于治疗硬质镜不能到达的深部支气管异物有显著优势，但技术难度高。

　　从2007年开始与国家CDC联合，搜集约3000份下呼吸道标本,监测常见14种呼吸道病毒以及支原体细菌等检测，并从分子、细胞、器官整体水平进行科研，紧密结合临床，为呼吸道感染诊治打下良好基础，也为国家防治公共突发卫生事件，计划免疫政策提供资料依据。