泌尿外科为医院的重点发展科室之一，成立于1979年。科室现有正规病床30张。现有正主任1名，副主任医师5名，研究生3名。多年来不断派出医师到国内著名医院进修学习，如广州中山医院、上海六院等，并和这这些医院的泌尿外科建立了良好的协作关系，技术处于省内先进水平。
　　
　　科室动态：本科室现拥有德国生产的膀胱镜、日本全进口OLMPBUS等离子电切镜、WOLF输尿管镜、STORS腹腔镜、钬激光、WOLF输尿管内切开刀、尿流动力学仪、德国全进口体外震波碎石机、瑞士进口气压弹道碎石机（EMS）等。其中以等离子电切镜、体外震波碎石机为合肥地区最先进手术仪器。科室以解决泌尿系统肿瘤（如肾癌、肾上腺肿瘤、膀胱癌、前列腺癌等）、泌尿系结石、前列腺增生症等，及各种泌尿生殖系统疑难病为重点，以微创泌尿外科手术为特色，并可以完成难度较大的巨大肾癌根治术，及下腔静脉癌栓取栓术，巨大肾上腺肿瘤切除术，全膀胱切除术加各种尿流改道手术，原位低温介入灌注条件下开展各种复杂保留肾单位肾脏外科手术。