甘肃省第二人民医院消化内科在病人中享有良好声誉，是医院的品牌科室，属省级重点学科。这个学科在人才引进和设备增添方面迅速发展，是一支技术过硬、服务到位、团结进取、乐于奉献、信得过的队伍。科内拥有先进的GF-UM2000、GF-UMT2000超声内镜、OLYMPUS-GIF-XQ240胃镜、CF-2401肠镜、JF-240十二指肠镜，特别在消化内镜诊疗、内镜下胆道疾病的诊疗、重症急性胰腺炎的综合治疗、急性上消化道出血、食管癌诊治方面已达到较省内先进水平。内镜下钛夹、注射、硬化、电凝等方法治疗上消化道大出血；肝硬化食道胃底静脉曲张硬化及套扎治疗；经内镜高频电凝胃肠道息肉切除术及粘膜切除术；消化道异物取出术；食道及胃肠道支架置入术；经皮经肝胆道造影（PTC）;经内镜逆行胰胆管造影（ERCP）；十二指肠乳头括约肌切开术（EST）；胆道碎石取石术；鼻胆管引流术；胆道支架置入术。科室病床使用率始终保持在在%以上。在肾病治疗领域中，该科在省内率先使用BaRd活检枪开展了肾穿活检，并配备了先进的德国费森尤斯血透机、德国贝朗CRRT持续性血液滤过机、双泵血滤机，开展了血液净化（血液透析、血液灌流、血液滤过、大量腹水浓缩回输等）技术，年血液透析病人保持在2000余人次，对肾囊肿硬化治疗、肾病综合征、狼疮性肾炎、紫癜性肾炎及复杂尿路感染等疾病的治疗取得了良好的疗效。医院针对需血液透析的患者设有免费专车接送，透析价格低廉，没有其他附加收费。