赣南医学院第一附属医院眼科是一支团结进取、勇于开拓、求真务实的队伍，在省内及赣南周边地区享有较高的声誉。科室人才梯队结构合理，专业技术力量雄厚，现有高、中级医师专业人才9名，在职硕士研究生1名，同时科室还拥有一支专业水平高、责任心强的护理队伍。本科室拥有赣州市最先进和完整的高、精、尖医疗设备，最整洁优雅的病房。
赣南医学院第一附属医院眼科一贯保持与时俱进的优良作风，紧跟现代医学发展前沿，学科发展迅速，达到国家卫生部三级甲等医院重点科室技术水平。近年来先后开展了一大批高难度技术，如角膜移植手术、玻璃体切割术、视网膜脱离复位术、羊膜移植术、小切口白内障摘除人工晶体植入术、青光眼手术、眼眶肿瘤切除术眼内异物取出术、激光泪道成行术，这些项目均处于省内领先水平。最近又新引进准分子激光原位角膜磨囊术（LASIK）和超声乳化白内障摘除人工晶体植入术。特别是自1999年以来，该科被省卫生厅指定与澳大利亚霍洛基金会合作，成立了“中澳白内障合作项目赣州市手术培训中心”，积极帮助困难地区建立并培训治疗白内障患者的医生，应用“白内障摘除术人工晶体植入术”技术，为3千余名白内障患者带来了光明，为“视觉第一中国行动”作出了突出贡献，荣获“全国残疾人康复工作先进集体”和“中澳白内障合作项目先进集体”等称号。
该科非常注重学术研究和科技创新，在学科带头人曾祥云主任和王辉副主任的带领下，多年来已形成了白内障、青光眼、眼表泪液病三个稳定的研究方向，主持和承担了多项江西省教育厅资助课题，在白内障、青光眼、羊膜移植等方面处于全省领先地位，有二项研究成果获得省内领先，国内先进水平，并分别获省、市科技进步奖和国家专利项目。全科人员在国内外各级杂志发表学术论文40余篇，主持卫生部国家级继续教育项目1项，省院级课题10余项。有5项课题获省内验收。在搞好医疗、科研的同时，眼科学作为赣南医学院临床医学耳鼻喉分流专业的主干课程，为国家培养了一大批合格的人才，受到了各级医疗卫生单位的青睐。同时该科还拥有省内一流的教学实验室。1998年被市卫生局批准为“赣州市低视力康复指导中心”、1999年被省卫生厅授予“中澳白内障项目赣州市手术培训中心”、2003年被市卫生局授予“赣州市领先专业学科”，2004年被省教育厅授予“江西省“十五”重点建设学科”。