赣南医学院第一附属医院中医科是集内、外、妇、儿杂病进行中医及中西结合治疗的综合科室。设有中医门诊、中医病房、伤科、针灸科。该科长期担任赣南医学院中医教学任务，人员素质高，技术力量雄厚，现有高级职称4人，中级职称2人，初级职称1人。
中医门诊及病房对诊治各种慢性病及外感疾病、心脑、脾胃及气血津液等各种病证均有独到的疗效，中医病房采用中西结合疗法，尤其对各种关节炎、神经官能症、中风后遗症、肾结石等有显著疗效。
针灸科多年来重点开展神经科系统伤病的针灸治疗，治愈大量中风、颅脑损伤及其它神经伤病患者，近年来又重点开展了小儿脑瘫的头针专项治疗，取得较好效果，对针灸常见病种关节炎、颈、肩、腰腿疼痛、面瘫、三叉神经痛等治疗手段丰富，疗效独到，深得广泛好评。
中医伤科禀承传统伤科治疗方法，结合现代新技术，治疗各类骨折、挫伤、软组织损伤。采用牵引新技术治疗腰、颈椎椎间盘突出症、腰肌劳损、风湿关节疼痛等，内服与外敷结合、手法并用，疗效可靠。