心外科始建于1958年，成立初期，在周恩来总理的直接关怀下，积极与发达国家相关医疗机构进行交流学习，为我国心血管外科事业的发展起到了具有深远意义的带动作用，是国内心血管外科的开拓者之一。经过半个多世纪的不懈努力，心外科已发展成为中国南方最大的心血管外科治疗中心，在国内心血管治疗领域享有很高的声誉和地位。1996年评为广东省“五个一科教兴医工程”重点专科，2002年、2008年均被评为广东省医学重点专科，2011年评为国家临床重点专科。
　　心外科为广东省人民医院广东省心血管病研究所一级业务科室，下属成人心脏外科、小儿心脏外科、心外麻醉、体外循环、心外科手术室及心外重症监护一区、心外重症监护二区等多个二级专业科室，现有床位205张，心外独立手术室10间，配备了世界先进水平的医疗与科研设备。心外科现有职工318人，其中高级职称人员45人，具有博士学位26人，具有硕士学位30人。有博士导师3名，硕士导师9名，是我国最早的硕士、博士学位授予点之一。拥有庄建、吴若彬、肖学钧、陈寄梅、郑少忆、卢聪、范瑞新、郭惠明等一批国内著名的心血管外科专家。心外科大部分技术骨干均曾赴美国、德国、澳大利亚、日本等国进修学习。
　　在半个世纪的光辉历程中，心外科曾经开创了许多国内领先技术：如人工心脏瓣膜置换术、冠状动脉大隐静脉搭桥术、小儿人工心脏瓣膜置换术、主动脉球囊反搏、心室辅助装置植入等。如今在瓣膜成形、重症心脏瓣膜手术、冠状动脉搭桥、胸主动脉瘤切除人工血管置换及复杂先天性心脏病和婴幼儿重症先天性心脏病等方面的治疗均保持国内领先水平。
　　近年来，心外科勇于挑战，不断创新。1998年，实施了广东省首例心脏移植术；心外科自主研发的心室辅助装置也于1998年成功应用于临床，填补了国内空白；2006年完成了广东省首例心肺联合移植术。2007年成功地为出生仅9小时的复杂先天性心脏病患儿施行大动脉调转术，是国内最小新生儿患者成功地接受此类复杂外科治疗。2007年起至今广泛采用人工腱索二尖瓣成形技术，疗效显著，使很大一部分二尖瓣病变患者避免了瓣膜置换。2009年成功完成全降主动脉置换和再次主动脉置换等高难度手术。大血管手术每年已超过150例，成为国内完成该类手术数量最多的心脏中心之一。2010年成功地为体重仅为600克的早产患儿施行心脏手术，是迄今为止国内报道体重最轻的心脏手术患者，2011年成功为仅3个月大的婴儿施行二尖瓣置换术，是迄今为止国内报道年龄最小的心脏瓣膜置换术患儿。现每年新生儿手术量已突破一百例，体重小于3公斤、年龄在3个月以内的重症复杂先心病患儿手术死亡率已降至2.3%，接近国际先进水平，是我国开展新生儿心脏手术最多、水平最高的单位之一，标志着心外科尤其是小儿心脏外科达到了国际先进水平。心外科共完成手术近4万例，2011年心脏大手术量达4000余例，手术数量与质量均居国内先进水平。瓣膜外科是该院心外科的传统优势专业，现普通瓣膜的手术成功率达99%以上，达到国际先进水平。在发展优势专业的同时，大胆创新，广泛开展了微创心脏外科手术，使病人以最小的创伤治愈心脏疾病。
　　心外科自成立以来，在科研工作上也结出累累硕果，先后承担过国家“七五”、“九五”、“十五”、“十一五”、“十二五”等多项国家重大攻关课题及国家和省部级课题。相关研究成果曾获国家攻关重大科技成果奖1项及国家级奖4项，部省厅级奖近20项。近5年来在国内外专业期刊发表论文200余篇。2011年被评为“国家临床重点专科”。
　　现任科主任庄建主任医师，为中华医学会胸心血管外科学分会副主任委员，中南六省胸心外科学会主任委员，广东省医学会胸心血管外科学分会主任委员。在小儿先心病领域有很深的造诣，在国际上首先建立和开展室间隔缺损补片留孔的姑息性大动脉调转术，完成国际上最大宗主肺动脉下腔静脉直接吻合法全腔静脉肺动脉连接术，在国内首先开展可调式房间隔造口技术、肺动脉右心室直接吻合术、先心病产前诊断和产后治疗一体化治疗模式的临床应用，在国内率先建立起首个省级先心病监测网。心外科另有多名中青年专家在国家及省级胸心血管外科学会中任重要职务。
　　经过半个世纪的努力，凭借雄厚的技术实力以及不断探索、勇于创新的精神，心外科已成为该院的著名品牌。在未来的日子里，全体心外科人员将继续努力，为心血管疾病的医学研究和临床治疗作出更大的贡献，“以更好的技术，服务更多的病人”永远是他们不断的追求。