针灸康复科成立于2001年，为国家中医预防保健与康复服务能力建设单位，国家中医药管理局“十二五”重点专科协作组成员，江西省“十一五”中医特色专科，省级重点中医专科，973计划课题--《热敏灸规律及其科学基础研究》合作单位，赣州市唯一一家采用中西医结合康复治疗的多功能学科；

针灸康复科目前共设有置病床数达100张，康复治疗大厅1个；理疗室1个；灸疗室2个；中药熏蒸室1个；专科门诊1个；中医综合治疗室2个；科室业务使用面积达2000余平米。其规模在赣州市的针灸康复居于领先位置；本科技术力量雄厚，现有医护人员45人，医师12人，其中高级职称1人，中级职称5人，初级6人，硕士研究生5人，本科7人；治疗师9人，其中本科6人，大专3人。

针灸康复科拥有本地区一流的中医康复大厅、热敏灸治疗室、中药熏蒸房和中医综合理疗室。对颈椎病、颈性眩晕、腰椎间盘突出症等颈肩腰腿痛疾病的诊治，注重中西手法互补，遵循“内外兼治、筋骨并重”原则，已形成一套以正骨推拿为主，结合针刺、热敏灸、中药烫熨、熏蒸及物理治疗的特色治疗系统，后期运用肌筋膜拉伸运动及核心肌群功能锻炼明显降低患者复发率。在中风病康复中应用“热敏化点艾灸”疗法，配合“醒脑开窍针刺”法，并首创“激发重建脊柱中轴平衡”康复理论，并独创脊柱小关节及躯干肌群功能激发重建康复治疗与脊柱中轴平衡康复治疗方法，在临床中取得显著疗效。骨性关节炎、骨折术后等骨关节疾病康复中，充分发挥科室中药熏蒸、针刺、热敏灸等特色疗法的基础上，结合关节松动术及物理治疗，形成了科室独特的康复体系。