心血管内科是该院的重点科室，拥有雄厚的技术力量和先进的技术设备，于1999年10月升为一级独立科室，床位由31张扩大为40张，还拥有二级科室心导管介入治疗室及心功能辅助检查室。专业医师有17人，其中高级职称7人（主任医师6人、副主任医师1人），其中1人为硕士生导师，教授3人，分别担任福州市康复学会会长、省医学会心血管分会常委、医学会秘书，主治医师4人。2001年以来与美国奥卡拉心脏中心多次在心外和心内介入方面开展临床合作和学术交流；2002年取得福州市科技局科研课题立项。2000年以来先后派出多名医师前往上海瑞金等医院进修心脏病学及心脏介入，其中一人目前在攻读电生理硕士研究生。心内科目前除对心血管常见病多发病进行治疗外，在心血管疑难病诊治以及危重病抢救方面具有相当高的水平和成功率，每年住院率突破 100％，而且呈逐年上升的趋势(去年为108％，今年上半年125％)去年收住952人，今年预计突破1000人。在此基础上该科拥有众多国内外先进的医疗设备：美国进口的Q-12型活动平板、美国进口的 BIOX—180B型24小时动态血压、美国进口的H—SCRIBEII型十二导联HOTLER、美国OEC-9600C臂+L臂DSA系统的X光机及先进的二维超声心动图等。目前能熟练开展具有省内先进水平的冠脉造影术、永久起搏器安置术、射频消融术、食道调搏等。