福建医科大学附属协和医院胸外科（http://www.xhxwzl.com）创建于1959年，是福建省最早成立的普胸专业科室。现为福建省胸心外科学博士点基地暨福建省胸心外科研究所，是福建省首批医学重点学科。50年来，在胸部疾病领域进行临床、科研、教学工作方面取得重大成绩。胸外科拥有一批德高望重、技术精湛的老专家，也有一批高素质、高学历年轻化的专业技术人员，现有主任医师、教授5人；副主任医师、副教授2人；主治医师4人，其中博士6人、硕士6人。在著名胸外科专家周仑教授、林培裘教授、林若柏教授的带领下，胸外科始终保持在肺癌、食管贲门癌、纵隔肿瘤和其它胸部疑难疾病诊疗的领先水平，在国内、省内率先开展新项目十余项，多方面达到国内领先或先进水平。
　　在肺外科方面：除开展大量常规肺癌手术外，在省内率先于80年代开展气管、支气管、隆突成形手术治疗肺癌及复杂严重的气管、支气管外伤，已成功开展近百例，开展最早、例数最多。近年开展对局部晚期肺癌的扩大切除根治术，包括在体外循环下对侵犯左心房的肺癌作肿瘤切除及左心房切除重建术，达到国内先进水平。对晚期肺癌癌性胸水患者在国内率先开展热循环灌注治疗，已完成近300例，病人生存期显著延长，生活质量明显改善，取得满意的效果，成为胸外科临床的特色项目，获省科技进步三等奖。
　　在食管外科方面：省内最早开展三切口食管癌根治术，已积累近千例经验；50年代在国内首先开展结肠代食管术，其治疗胃切除术后食管癌者，例数多，效果好。近年在国内首创颈腹段食管结扎治疗自发性食管破裂，成功率高。此外在食管异物导致胸主动脉感染破裂出血治疗、食管功能检查诊断食管两性疾病及返流性食管炎和评价术后胃肠功能状况等研究方面也获得了很好的成绩。
　　此外，福建协和医院的纵隔肿瘤切除术，切除率高，疗效好，近年还开展了上腔静脉置换等高难度手术，向国内水平看齐。对胸壁肿瘤切除后大块缺损的修复，该科有不少成功的经验。
　　在电视胸腔镜和电视纵隔镜方面：胸腔镜微创手术具有切口小、创伤少、痛苦轻、美容效果好等优点，治疗肺、食管、纵隔和胸外伤等20多种疾病、13种手术方式：包括胸腔镜下肺叶切除术、肺楔形切除活检术、肺弥漫性疾病诊断、肺减容、漏斗胸微创矫治、纵隔肿瘤切除术、手汗症、心包积液开窗、胸部创伤、肺大疱和气胸治疗等。应用纵隔镜活检纵隔疑难疾病和肺癌术前分期达到省内领先水平，省内开展最早，例数最多。
　　在肺移植方面：该科90年代就开始肺移植动物实验，开展供肺保存、肺功能保护、抗排异等系列研究。在此基础上，于2005年开始临床人同种异体肺移植，已成功实施单肺移植2例，双肺移植1例，其中1例已存活2年以上，达到国内先进水平，使该院成为全国首批获得卫生部批准同意开展肺移植的少数几家医院之一，也是全省唯一获此殊荣准予开展肺移植工作的单位。
　　近年来，胸外科在国家级、省级刊物发表论文80多篇，获全国科学大会成果1项，省科技成果奖2项，省医疗卫生科技成果奖3项，中国八五科技奖1项，并承担省科研项目10余项，承担福建医科大学本科和硕士、博士研究生的教学工作，多次举办国家和省级继续教育学习班。随着医疗卫生改革的进一步发展，胸外科拥有完善和先进的抢救监护设备和高素质的医护人员，并愿以更高的服务水平，更精湛的医疗水平，更好的医疗设备服务于社会和广大群众。