福建医科大学附属协和医院检验科是集医、教、研三位一体的临床检测实验室，设立有临床生化实验室、临床免疫实验室、临床微生物实验室、临床检验实验室、临床分子生物诊断实验室、流式检测实验室和遗传检测实验室等七大专业。该科各专业组均参加卫生部和福建省检验中心的质量控制工作,每年均取得优秀成绩，成绩名列全省前茅；该科的临床微生物和临床血液实验室在全省乃至全国都有较高的知名度，已经成为福建省的进修基地，每年接收全国各地的进修人员50多名，PCR室也成为福建省首批的实践培训中心。每年在参加卫生部和福建省临检中心质控工作取得优秀成绩的基础上，1980年就开始在全国率先参加WHO的微生物质控工作，并取得优异成绩，受到国内同行的好评；同时该科在免疫调节特别是对我国首创的混合皮肤移植技术的免疫学机理、白血病发病的分子机制和治疗的研究方面的达到了国内外先进水平，并在国际著名杂志PNAS、Blood和Transplantation上获得发表了多篇论著，获得专家好评。该科以一流的技术，一流的质量，一流的服务，以病人为中心，竭诚为广大患者提供优质的服务。由于医学检验学是一门进展很快的学科，检验仪器与检验方法的不断更新使得该院检验科培养了一批技术过硬的科研型人才，该科检验科在职人员69名，各个专业均有该专业的学科带头人。检验科在人员的配备上有着很强的实力，具有高级职称10人，博士学位5人，硕士生导师3人，分别在全国或区域性的学术团体任职，同时在医院领导的支持下，将继续支持有发展潜力的工作人员报考博士、硕士或其他类型的进修，全面提高该科的人员素质和该科综合实力，更好的为临床提供快速、准确、先进的实验诊断数据。同时主编和参编《临床实验室管理》、《分子诊断学》和《分子诊断学实验指导》等多部全国性规划教材，获得省部级科技成果奖多项。负责的《实验诊断学》获得福建省精品课程。
　　近年来，由于生物化学、计算机技术和分子生物学技术在临床医学检验中的应用，临床检验手段大多从手工操作过渡到全自动化检测，该院检验科在上个世纪90年代就开始进行临床检验自动化工作；当前该科在临床标本的分析检测方面已基本实现了全自动化。当前国内医疗卫生制度特别是公费医疗制度改革正逐步深化，该院检验科具有高科技含量的检测项目、高质量的检测结果、科学的检验项目组合及经济便捷的服务方式，因此在为更好地服务于广大患者方便就医方面中具有一定的优势。为了给广大患者提供一个方便、经济、温暖的就医环境，首先该院检验科将数百项检验项目按不同的功能进行了科学的检验组合，避免了患者因重复化验在经济和时间上的浪费。其次，按专业不同把各种组合好的项目印成了不同的化验单，这样即方便了医生在化验项目上的选择，也便于患者划价、交费和及时的取结果。同时为了病人的需要，也欢迎根据不同情况进行单个目的检查，并成为福建省内检验收费最为经济的检验科之一。
　　随着检验仪器与检验方法的不断更新，检验人员技术水平的不断提高，该科的检测项目和标本分析处理能力也不断加强。当前该科开展的检测项目近千项，日分析标本量分别达到2000份以上的标本量（20000多单项）。不仅如此，历年来该科在检验数据的计算机信息管理方面也作了大量的工作，已逐步实现实验室信息化管理。为了方便门诊病人，还设立网上检验报告单查询系统，病人当晚在家上网输入条形码号和姓名就可以查询到自己的报告单。
　　同时作为福建医科大学附属医院，该科承担了福建医科大学研究生、检验本科、临床医学本科、药学本科、影像本科和公共卫生管理本科的大量教学工作，近年来承担了国家自然科学基金、福建省自然基金、省教育厅和卫生厅青年基金资助的科研项目20余项，提高了该科的学术实力。