复旦大学附属肿瘤医院病理科创立于1949年，是新中国最早的病理科之一。经历了在一代又一代病理工作者坚持不懈的追求和艰苦奋斗，在各级领导的关心和支持下，病理科逐渐发展成为国内著名的病理诊断中心：集国家重点学科、卫生部重点学科、上海市医学重点学科于一身，也是上海市临床病理质量控制中心挂靠单位；一支专业知识全面，技术力量雄厚的学术队伍已经形成。 　　2009年，科室主体迁入新建的二号楼，目前科室总面积达3500平方米，现有人员54人，其中有5位荣誉教授和返聘教授。在职医生中，具有正高级职称者5人，副高级职称者11人，80％以上有国外进修经历。 　　病理科承担着院内外大量诊断工作，随着新技术的开发和应用，科室已经逐步建立起“病理形态-－免疫组化－分子病理技术相结合的综合诊断平台”，并成立了淋巴瘤、乳腺、胃肠道、胸部、软组织和骨肿瘤、泌尿、细胞病理、免疫病理、分子病理共9个专科病理组 。病理会诊是肿瘤医院的特色项目，每年窗口接待来自全国的会诊病例近16000例，其中疑难病例占一半以上，是全国会诊工作量最突出的科室之一。 　　作为最早的研究生及进修生、住院医生培养基地，科室共培养了千余名病理学工作人员，多次举办全国性病理诊断学习班。病理学者在工作之余，笔耕不辍。撰写并发表了大量专业书籍和论文，在病理学领域开展了深入的研究工作。秉承“学术在于交流”的优良传统，科室每年均举办或承办大型的病理专业会议，为全国病理水平的整体提高做出了突出贡献。