北京中医药大学东直门医院泌尿外科是北京市重点学科。秉承着“以中西医结合为方向，走有中国特色的医疗卫生事业之路”的宗旨，在历届主任和专家的带领下，已发展成为在国内具有较大影响力的以中西医结合为特色，以泌尿系统结石、肿瘤及前列腺疾病为重点，以中医特色诊疗与现代微创技术相结合为治疗手段的集临床、教学、科研于一体的现代化科室。该科聘请我国泌尿外科腹腔镜技术奠基人之一，国家863首席科学家，享誉国际、有“腹腔镜和机器人手术大师”之称的中国人民解放军总医院(301医院)泌尿外科主任张旭教授和国家名老中医药专家，北京国医名师，国家重点学科“中医外科学”、“中医男科学”学术带头人李曰庆教授分别为学科西医和中医顾问。
经过多年人才培养和建设，形成了一支由著名专家、博士、硕士组成，以高层次、高技能为业务骨干，梯队合理，方向明确的团队。2016年5月，东直门医院东区泌尿外科(通州)正式成立，至此，东直门医院泌尿外科形成“一科两区”(东区+西区)格局，实现统一管理、协同发展;学科建设“立足主城、开拓通州(北京市行政副中心)、辐射周边、放眼全国”。科室医疗技术力量雄厚、专业人才结构合理。该科共有医务人员31名，其中医生17名，主任医师3名，副主任医师3名，主治医师8名，住院医师3名。博士研究生导师1人，硕士研究生导师2人。博士后1名，博士2名，在读博士2名，硕士9名。现任学科带头人闫永吉主任，是北京中医药大学硕士研究生导师，中华医学会男科分会全国青年委员，北京市中西医结合泌尿外科学会委员，《微创泌尿外科杂志》、《泌尿外科杂志(电子版)》、《医学参考报泌尿外科和男科学频道》编委。长期从事泌尿科临床和教学工作，先后师从“863计划”首席科学家，我国泌尿外科腹腔镜技术奠基人，中国人民解放军总医院泌尿外科主任张旭教授和首都国医名师，国家重点学科“中医外科学”、“中医男科学”学术带头人李曰庆教授，擅长各种泌尿外科微创手术，多次受邀在国际、国内学术会议进行手术演示。目前致力于中医特色诊疗与泌尿外科微创技术相结合的研究和临床应用工作。