北京中医药大学东直门医院消化内科有着悠久、辉煌的历史，董建华院士、殷凤礼教授等人于1980年组建消化内科，在中医院中第一个把消化内科设为独立科室。本科室是国家中医药管理局重点专科、重点学科单位，中医内科主要科室之一，是国内首批中医博士点授予单位，培养了中国第一个中医博士。
　　经过30多年的建设发展，目前消化内科设病床32张，设门诊、病房、胃镜室、13C-尿素酶呼气试验检测室、中医综合治疗室,开展了普通胃镜检查、无痛胃镜检查及内镜下息肉切除等内镜下治疗，开设了胃食管反流病专科门诊、解酒戒酒专科门诊、脂肪肝专科门诊，开展了中药脐敷、泡洗、漱口、肝病低频脉冲治疗、　　红光照射等一系列中医特色诊疗项目；
　　本专科在慢性肝病（脂肪肝、酒精性肝病、病毒性肝炎、肝硬化及肝癌前病变等）、慢性胃病（慢性萎缩性胃炎、难治性溃疡及胆汁返流性胃炎）和慢性肠病（慢性结肠疾病、功能性肠病）三方面形成了具有国内学术领先水平、具有临床疗效优势和中医诊疗特色的优势病种，在国内享用较高的声誉。针对上述消化系统疑难疾病，经过多年研究，开发出系列院内制剂，可供不同的患者使用，受到广大患者的好评。
　　消化科现有一支从博士生导师、主任医师到普通住院医师，临床经验丰富，科研水平高的队伍，能为不同的患者提供最优的治疗方案，以期达到满意的疗效。