肛肠科是以大肠肛门疾病为特色的专科。承担我院该学科的医疗、教学、科研、预防等任务。现有在编职工15名，硕士学位2名，VIP病房3间，内设数字化全智能肛肠科专用卫生间。开放床位25张，是目前东莞市各镇区医院唯一设有独立专科病区的科室，其技术设备全市领先。病人幅射面至珠三角，在省内有一定的知名度. 该科现设有肛肠专科门诊、便秘专科门诊及住院部。
　　该科从门诊检查，住院术前、术中、术后均配备了先进的检查治疗系统，构建成数字化诊疗平台。DE-01S型肛肠内窥镜诊疗仪，是最新先进的实用新型医疗设备，用于肛管、直肠、乙状结肠疾病的诊断。其最大的特点：窥镜为一次性使用，避免交叉感染，提供图文并茂的诊断报告。等离子数字化治疗系统――DNR EU等离子PMM技术，等离子肛肠治疗系统（数字热能治疗系统）是目前欧美发达国家最为先进的肛肠治疗系统，实现了肛肠疾病全程微创手术。数字化大肠透析系统，提高了住院的检查成功率及准确率。通过大肠水疗、清洁肠道，无需患者口服泻药等待时间，方便了患者需要。数字化全自动肛门熏冼系统，将传统的中药熏冼，提高到数字化的平台，实现了超声雾化、红外线烘干，各系统冲洗一体化的全自动的治疗过程，对于不同种疾病采用不同的治疗手段。三大系统构建成数字化诊疗平台，成为全市的特色专科之一。
　　便秘专科门诊引进了盆底功能障碍性疾病治疗系统---加拿大tought公司生产的最新一代myotrac生物刺激仪，其具有国际认证的Glazer评估及丰富多样化的治疗方案，包括盆底神经肌肉电刺激、盆底肌电触发刺激、模式、具有针对性、个性化的治疗特点，治疗过程无痛无创，轻松愉悦，疗效显著。
　　肛肠科诊治范围：
　　1.各期痔疮、肛裂、肛瘘等肛周常见病；
　　2.溃疡性结肠炎、克罗恩病等大肠炎症性疾病；
　　3.结直肠癌、大肠息肉等大肠肿瘤性疾病；
　　4.肛门、肛管、直肠与会阴损伤；
　　5.肛周湿疹、尖锐湿疣等肛周皮肤病及性传播疾病；
　　6.功能性便秘（大便干结、排便困难、粪便量和次数减少等）、直肠前突、会阴下降、特发性肛门直肠痛（肛门坠胀感）、大便失禁、术后排便功能恢复等盆底功能障碍性疾病。在国内外发表多篇学术论文。