南京医科大学附属常州二院呼吸科始建于1979年，近30年来得到飞速发展。1997年成为常州市临床重点专科，2002年成为江苏省临床重点专科，2003年成为常州市重点学科，是南京医科大学硕士教学点，南京医科大学研究生、本科生的教学点，苏州大学医学院、徐州医学院、江苏大学医学院、安徽省蚌埠医学院的实习基地及常州市住院医师规范化培训基地。现有主任医师3名，教授1名，副教授1名，副主任医师6名，硕士研究生导师2名，博士研究生2名，在读博士后1名，硕士研究生以上学历者14名，在读研究生1名。
　　分设2个病区，拥有总床位数83张，其中重症监护床位数13张。科室下设呼吸重症监护室（RICU）2个、纤维支气管镜室2个，肺功能室2个、睡眠呼吸障碍研究室、呼吸科专科实验室各1（包括血气分析室、病原学检查室）等专科诊疗及研究室。科室设备方面拥有西门子300伺服呼吸机、西门子Servo i 呼吸机、BiPAP呼吸机、多功能床边监护仪、床边肺功能仪、血气分析仪、电子纤支镜及胸腔镜、多导睡眠监测系统、超低温冰箱、全自动酶标仪等多项先进专科仪器及设备。
　　近年来开展各种新技术、新疗法20余项，在机械通气、呼吸病介入技术如经纤支镜高频电刀、氩气刀、冷冻、支架治疗气道狭窄、支气管动脉栓塞治疗咯血、肺血栓旋切术、肺栓塞射频消融术、125I粒子植入治疗肺癌等技术达到国内先进、省内领先水平。常规开展纤支镜及胸腔镜检查、灌洗、气道清理及组织活检、纤支镜取异物、血气分析、肺功能测定、呼吸专科病原学检查、多导睡眠监测、nCPAP治疗睡眠呼吸暂停综合征等项目。2010年还新开展了隆突重建Y形镍钛合金气道支架安放及呼吸道病毒抗原免疫荧光法检测、军团菌抗原抗体检测项目，技术水平达到省内及市内领先。
　　呼吸科年门诊量20000多人次，年住院1600多人次，国家自然科学基金课题1项，江苏省厅级课题2项，常州市局级课题9项，近10年来共发表论著100余篇，其中SCI收录论著5篇，中华系列期刊论著4篇，核心期刊论著80余篇，出版专著2部。共获得省卫生厅科技进步一等奖1项，省卫生厅新技术引进奖4项，常州市科技进步二等奖1项、常州市科技进步三等奖1项及常州市科技进步四等奖1项。
近年来，呼吸科全体医护人员在学科带头人的带领下，勇于探索、积极创新，在呼吸系统肿瘤、呼吸系统疾病介入治疗及呼吸衰竭临床诊治新方法等方面取得了长足进步，在江苏省内具有较高的学术影响力。