长汀妇幼保健院超声科位于该院2号楼三楼，在厦门市妇幼保健院超声骨干的常年指导及科室全体医师的努力下，超声诊断水平在省内县级妇幼处于领先地位，已成为长汀及周边地区妇产科筛查中心。
　　全科现有医护人员共7名，科室拥有目前世界上较为先进的GE、飞利浦、东芝全数字化进口高档彩超及四维等仪器，这实现了电脑化管理，通过多机联网，图文资料存储、处理及查询简单而快捷，极大地提高了工作效率，同时在医疗科研中发挥了重要的作用。
科室采用现代超声影像技术，向全社会开展疾病诊断范围几乎涵盖全身，包括：妇科和产科；小儿心脏；乳腺和体表器官软组织；肝胆脾胰、泌尿系统、盆腔脏器。诊断手段除常规二维超声和彩色多普勒超声外，还开展了经阴道超声、四维超声、及中期产前、小儿髋关节等多种先进技术，具有丰富的临床经验，达到省内县级先进水平。
　　在业务特色上，设置了二级超声筛查，分别对孕10―13+6周进行胎儿NT检查（即胎儿早期畸形筛查），15-20周进行胎儿NF检查，此时期主要进行遗传学超声检查，同时对一些大体结构畸形如无脑儿等的检测；孕22-26周常规及系统超声筛查，此时期是检测大部分结构畸形的最好时期和孕30--34周彩色超声检查，能够发现22-16周不能发现或尚未出现的畸形。另外还开展了胎儿超声心动图检查、针对性筛查、及四维超声检查，不仅对常规筛查项目进行了有效的补充，而且更加详细、明确的提供产前诊断。四维超声检查不仅更加详细，而且更加形象便于孕妇理解。该科近些年来每年产前筛查出各类胎儿畸形符合率达95%以上，阻止了一些严重胎儿畸形的出生，为提高我国人口素质做出了重大贡献。