常熟市第二批临床重点专科 分设儿内科和新生儿科及6个专业科组,有46张床位,其中新生儿科床位11张。在扎实的临床诊疗基础上,加强专科建设,使整体诊疗水平不断升上新台阶。获市科学进步奖,局新技术引进奖多项,共发表论文100余篇,在省市级杂志上发表了30余篇。作为儿童保健,疾病防治知识的宣传窗口,1999年开始，（http://www.cs-2k.com）网页面世。

　　新生儿科 为全市率先建立，现有床位11张（母婴同室）。新生儿生命监护仪、经皮黄疸测定仪、纤维光毯黄疸治疗仪、微量血糖仪为轻创、无创设备；红外线抢救台、呼吸机、肺活通的应用是重危新生儿救治的硬件保证。部分及全胃肠道外营养、呼吸管理、维持体温平稳使我们成功救治仅1100g的早产儿。高胆红素血症的监治为本科特色。

　　小儿哮喘专科 引进国际哮喘阶梯治疗方案治疗小儿哮喘，取得了满意的疗效，积累了丰富的吸入治疗经验。除临床诊治外，开展家庭治疗，举办哮喘夏令营。

　　小儿心血管专科 应用心肌酶谱,心肌肌钙蛋白检查确诊小儿病毒性心肌炎，并进行有效治疗，24小时动态心电图的监测,可区分心律失常的类型，开展了先天性心脏病的诊断和小儿高血压的诊治。

　　小儿肾脏专科 与苏州大学附属儿童医院合作开展肾活检，有助于各型肾小球肾炎的诊断，尿红细胞形态检查帮助明确血尿来源，对肾病综合症进行有效治疗。

　　小儿血液专科 开展了以血常规作为简单易行的营养性缺铁性贫血诊断标准和用药参考，并制定了阶段性铁剂治疗营养性缺铁性贫血的新方法。应用科学方案治疗小儿白血病，急性淋巴细胞性白血病长期缓解率达70%。

　　小儿神经专科 引进国际小儿癫痫分类及诊治方案、多种智商测试量表、注意力缺陷测定仪等。开展神经系统后遗症康复指导和情绪障碍心理咨询。

　　小儿内分泌专科 全市只有我院开展该专科，应用骨龄图谱和生长激素激发试验精确判断儿童生长情况，性激素激发试验正确判断儿童发育状况，开展小儿糖尿病、肥胖症的诊断和治疗。